Метаболоміка як складна мережа хімічних реакцій об'єднує всі характерні метаболічні властивості клітини, тканини або організму.
Сюди належать:
- показники швидкості потоку (= швидкості обертання), рівні метаболітів і активність ферментів окремих метаболічних шляхів;
- взаємодії між різними метаболічними шляхами;
- компартменталізація різних метаболічних шляхів у клітинах.
Іншими аспектами метаболоміки є вплив від надходження поживних речовин, вплив активних речовин на метаболізм і різні функції клітин, як-от проліферація, диференціювання та апоптоз.
Метаболомікою (англ. metabolomics або metabonomics) також називається вивчення метаболома. Цей напрямок досліджень займається взаємодією метаболітів, що містяться в метаболомах, їх ідентифікацією та квантифікацією (див. протеом і геном). Основними аналітичними методами, що використовуються в метаболоміці, є ГХ/МС і РХ/МС, а також ЯМР-спектроскопія та спектрометрія іонної рухливості. Отже, методи можна розділити на методи розділення, методи іонізації та методи виявлення. Оскільки метаболіти можуть сильно відрізнятися за хімічним складом і структурою, часто недостатньо використовувати лише один метод аналізу, щоб повністю розібрати метаболом окремого організму. Крім того, ще й досі невідомо, скільки всього продуктів метаболізму існує. Найпоширенішими типами таких продуктів є біологічні рідини організму, такі як плазма або сироватка крові, а також сеча, спинномозкова рідина, синовіальна рідина, мокротиння або лаваж. Поряд із попередніми розглядаються також гомогенати тканин або клітини або супернатанти клітинних культур.
Метаболом
Метаболом — це повний набір низькомолекулярних хімічних речовин, що містяться в біологічному зразку. Біологічним зразком може бути клітина, клітинна органела, орган, тканина, біологічна рідина або ж цілий організм. Низькомолекулярні хімічні речовини виявлені в метаболомі можуть містити як ендогенні або первинні метаболіти, які природним чином виробляються організмом (амінокислоти, органічні кислоти, нуклеїнові кислоти, жирні кислоти, аміни, вуглеводи, вітаміни, пігменти тощо), так і екзогенні або вторинні хімічні речовини (лікарські засоби, шкідливі речовини з навколишнього середовища, харчові добавки, токсини та інші ксенобіотики), які природним чином не виробляються в організмі.
Також вирізняють метаболом пухлини як характерний метаболічний фенотип пухлинних клітин. Трансформація нормальних клітин в пухлинні пов'язана з різкими змінами метаболізму клітин.
Походження слова
Термін метаболом був створений за аналогією з геномом, транскриптомом і протеомом. Слово походить від метаболізму (= обмін речовин). Іноді використовується позначення метабоном (через н), особливо в контексті оцінки токсичності активних речовин. У фахових колах активно дискутують щодо точних відмінностей між метаболомом і метабономом.
Див. також
Зовнішні посилання
- Human Metabolome Database
- Метаболічна база даних
- Метаболомічна база даних сечі
- Метаболомний атлас старіючого мозку миші
|
