Мы используем файлы cookie.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.
ATR (ген)
Подписчиков: 0, рейтинг: 0
ATR (англ. ATR serine/threonine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 644 амінокислот, а молекулярна маса — 301 367.
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGEHGLELAS | MIPALRELGS | ATPEEYNTVV | QKPRQILCQF | IDRILTDVNV | ||||
VAVELVKKTD | SQPTSVMLLD | FIQHIMKSSP | LMFVNVSGSH | EAKGSCIEFS | ||||
NWIITRLLRI | AATPSCHLLH | KKICEVICSL | LFLFKSKSPA | IFGVLTKELL | ||||
QLFEDLVYLH | RRNVMGHAVE | WPVVMSRFLS | QLDEHMGYLQ | SAPLQLMSMQ | ||||
NLEFIEVTLL | MVLTRIIAIV | FFRRQELLLW | QIGCVLLEYG | SPKIKSLAIS | ||||
FLTELFQLGG | LPAQPASTFF | SSFLELLKHL | VEMDTDQLKL | YEEPLSKLIK | ||||
TLFPFEAEAY | RNIEPVYLNM | LLEKLCVMFE | DGVLMRLKSD | LLKAALCHLL | ||||
QYFLKFVPAG | YESALQVRKV | YVRNICKALL | DVLGIEVDAE | YLLGPLYAAL | ||||
KMESMEIIEE | IQCQTQQENL | SSNSDGISPK | RRRLSSSLNP | SKRAPKQTEE | ||||
IKHVDMNQKS | ILWSALKQKA | ESLQISLEYS | GLKNPVIEML | EGIAVVLQLT | ||||
ALCTVHCSHQ | NMNCRTFKDC | QHKSKKKPSV | VITWMSLDFY | TKVLKSCRSL | ||||
LESVQKLDLE | ATIDKVVKIY | DALIYMQVNS | SFEDHILEDL | CGMLSLPWIY | ||||
SHSDDGCLKL | TTFAANLLTL | SCRISDSYSP | QAQSRCVFLL | TLFPRRIFLE | ||||
WRTAVYNWAL | QSSHEVIRAS | CVSGFFILLQ | QQNSCNRVPK | ILIDKVKDDS | ||||
DIVKKEFASI | LGQLVCTLHG | MFYLTSSLTE | PFSEHGHVDL | FCRNLKATSQ | ||||
HECSSSQLKA | SVCKPFLFLL | KKKIPSPVKL | AFIDNLHHLC | KHLDFREDET | ||||
DVKAVLGTLL | NLMEDPDKDV | RVAFSGNIKH | ILESLDSEDG | FIKELFVLRM | ||||
KEAYTHAQIS | RNNELKDTLI | LTTGDIGRAA | KGDLVPFALL | HLLHCLLSKS | ||||
ASVSGAAYTE | IRALVAAKSV | KLQSFFSQYK | KPICQFLVES | LHSSQMTALP | ||||
NTPCQNADVR | KQDVAHQREM | ALNTLSEIAN | VFDFPDLNRF | LTRTLQVLLP | ||||
DLAAKASPAA | SALIRTLGKQ | LNVNRREILI | NNFKYIFSHL | VCSCSKDELE | ||||
RALHYLKNET | EIELGSLLRQ | DFQGLHNELL | LRIGEHYQQV | FNGLSILASF | ||||
ASSDDPYQGP | RDIISPELMA | DYLQPKLLGI | LAFFNMQLLS | SSVGIEDKKM | ||||
ALNSLMSLMK | LMGPKHVSSV | RVKMMTTLRT | GLRFKDDFPE | LCCRAWDCFV | ||||
RCLDHACLGS | LLSHVIVALL | PLIHIQPKET | AAIFHYLIIE | NRDAVQDFLH | ||||
EIYFLPDHPE | LKKIKAVLQE | YRKETSESTD | LQTTLQLSMK | AIQHENVDVR | ||||
IHALTSLKET | LYKNQEKLIK | YATDSETVEP | IISQLVTVLL | KGCQDANSQA | ||||
RLLCGECLGE | LGAIDPGRLD | FSTTETQGKD | FTFVTGVEDS | SFAYGLLMEL | ||||
TRAYLAYADN | SRAQDSAAYA | IQELLSIYDC | REMETNGPGH | QLWRRFPEHV | ||||
REILEPHLNT | RYKSSQKSTD | WSGVKKPIYL | SKLGSNFAEW | SASWAGYLIT | ||||
KVRHDLASKI | FTCCSIMMKH | DFKVTIYLLP | HILVYVLLGC | NQEDQQEVYA | ||||
EIMAVLKHDD | QHTINTQDIA | SDLCQLSTQT | VFSMLDHLTQ | WARHKFQALK | ||||
AEKCPHSKSN | RNKVDSMVST | VDYEDYQSVT | RFLDLIPQDT | LAVASFRSKA | ||||
YTRAVMHFES | FITEKKQNIQ | EHLGFLQKLY | AAMHEPDGVA | GVSAIRKAEP | ||||
SLKEQILEHE | SLGLLRDATA | CYDRAIQLEP | DQIIHYHGVV | KSMLGLGQLS | ||||
TVITQVNGVH | ANRSEWTDEL | NTYRVEAAWK | LSQWDLVENY | LAADGKSTTW | ||||
SVRLGQLLLS | AKKRDITAFY | DSLKLVRAEQ | IVPLSAASFE | RGSYQRGYEY | ||||
IVRLHMLCEL | EHSIKPLFQH | SPGDSSQEDS | LNWVARLEMT | QNSYRAKEPI | ||||
LALRRALLSL | NKRPDYNEMV | GECWLQSARV | ARKAGHHQTA | YNALLNAGES | ||||
RLAELYVERA | KWLWSKGDVH | QALIVLQKGV | ELCFPENETP | PEGKNMLIHG | ||||
RAMLLVGRFM | EETANFESNA | IMKKYKDVTA | CLPEWEDGHF | YLAKYYDKLM | ||||
PMVTDNKMEK | QGDLIRYIVL | HFGRSLQYGN | QFIYQSMPRM | LTLWLDYGTK | ||||
AYEWEKAGRS | DRVQMRNDLG | KINKVITEHT | NYLAPYQFLT | AFSQLISRIC | ||||
HSHDEVFVVL | MEIIAKVFLA | YPQQAMWMMT | AVSKSSYPMR | VNRCKEILNK | ||||
AIHMKKSLEK | FVGDATRLTD | KLLELCNKPV | DGSSSTLSMS | THFKMLKKLV | ||||
EEATFSEILI | PLQSVMIPTL | PSILGTHANH | ASHEPFPGHW | AYIAGFDDMV | ||||
EILASLQKPK | KISLKGSDGK | FYIMMCKPKD | DLRKDCRLME | FNSLINKCLR | ||||
KDAESRRREL | HIRTYAVIPL | NDECGIIEWV | NNTAGLRPIL | TKLYKEKGVY | ||||
MTGKELRQCM | LPKSAALSEK | LKVFREFLLP | RHPPIFHEWF | LRTFPDPTSW | ||||
YSSRSAYCRS | TAVMSMVGYI | LGLGDRHGEN | ILFDSLTGEC | VHVDFNCLFN | ||||
KGETFEVPEI | VPFRLTHNMV | NGMGPMGTEG | LFRRACEVTM | RLMRDQREPL | ||||
MSVLKTFLHD | PLVEWSKPVK | GHSKAPLNET | GEVVNEKAKT | HVLDIEQRLQ | ||||
GVIKTRNRVT | GLPLSIEGHV | HYLIQEATDE | NLLCQMYLGW | TPYM |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Cimprich K.A., Shin T.B., Keith C.T., Schreiber S.L. (1996). cDNA cloning and gene mapping of a candidate human cell cycle checkpoint protein.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 2850 — 2855. PubMed DOI:10.1073/pnas.93.7.2850
- Schmidt D.R., Schreiber S.L. (1999). Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4.. Biochemistry 38: 14711 — 14717. PubMed DOI:10.1021/bi991614n
- Kim S.-T., Lim D.-S., Canman C.E., Kastan M.B. (1999). Substrate specificities and identification of putative substrates of ATM kinase family members.. J. Biol. Chem. 274: 37538 — 37543. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.53.37538
- Hall-Jackson C.A., Cross D.A.E., Morrice N., Smythe C. (1999). ATR is a caffeine-sensitive, DNA-activated protein kinase with a substrate specificity distinct from DNA-PK.. Oncogene 18: 6707 — 6713. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1203077
- Ward I.M., Chen J. (2001). Histone H2AX is phosphorylated in an ATR-dependent manner in response to replicational stress.. J. Biol. Chem. 276: 47759 — 47762. PubMed DOI:10.1074/jbc.C100569200
- Cortez D., Guntuku S., Qin J., Elledge S.J. (2001). ATR and ATRIP: partners in checkpoint signaling.. Science 294: 1713 — 1716. PubMed DOI:10.1126/science.1065521