| HDAC1
|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|
Символи
|
HDAC1, GON-10, HD1, RPD3, RPD3L1, histone deacetylase 1, KDAC1 |
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601241 MGI: 108086 HomoloGene: 68426 GeneCards: HDAC1
|
|
|
| Реагує на сполуку |
|
abexinostat, apicidin, belinostat, Масляна кислота, entinostat, givinostat, mocetinostat, panobinostat, pracinostat, quisinostat, resminostat, romidepsin, trichostatin A, Вальпроєва кислота, Золінза
|
| Онтологія гена |
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase activity • protein N-terminus binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein deacetylase activity • histone deacetylase binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • NF-kappaB binding • deacetylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleosomal DNA binding • enzyme binding • hydrolase activity • core promoter sequence-specific DNA binding • p53 binding • transcription factor binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin binding • Krueppel-associated box domain binding • E-box binding • promoter-specific chromatin binding
|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • NuRD complex • гіалоплазма • histone deacetylase complex • Sin3 complex • Нуклеоплазма • клітинне ядро • Хроматин • GO:0035328 Гетерохроматин • transcription regulator complex • transcription repressor complex • GO:0009327 protein-containing complex • neuronal cell body • Sin3-type complex
|
| Біологічний процес |
• hair follicle placode formation • epidermal cell differentiation • Ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • embryonic digit morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • зсідання крові • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • eyelid development in camera-type eye • circadian regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • odontogenesis of dentin-containing tooth • protein deacetylation • histone H4 deacetylation • fungiform papilla formation • negative regulation of myotube differentiation • GO:0022415 viral process • histone deacetylation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of signal transduction by p53 class mediator • DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • beta-catenin-TCF complex assembly • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of cell population proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone H3 deacetylation • regulation of megakaryocyte differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • endoderm development • циркадний ритм • hippocampus development • neuron differentiation • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • regulation of endopeptidase activity • regulation of amyloid-beta clearance • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
|
| Джерела:Amigo / QuickGO
|
|
| Шаблон експресії
|
 |
|
Більше даних
|
| Ортологи |
| Види |
Людина |
Миша |
| Entrez |
|
|
| Ensembl |
|
|
| UniProt |
|
|
| RefSeq (мРНК) |
|
|
| RefSeq (білок) |
|
|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 32.29 – 32.33 Mb
|
Хр. 4: 129.41 – 129.44 Mb
|
|
PubMed search |
|
|
| Вікідані |
|
HDAC1 (англ. Histone deacetylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 482 амінокислот, а молекулярна маса — 55 103.
Послідовність амінокислот
| 10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
| MAQTQGTRRK |
|
VCYYYDGDVG |
|
NYYYGQGHPM |
|
KPHRIRMTHN |
|
LLLNYGLYRK |
| MEIYRPHKAN |
|
AEEMTKYHSD |
|
DYIKFLRSIR |
|
PDNMSEYSKQ |
|
MQRFNVGEDC |
| PVFDGLFEFC |
|
QLSTGGSVAS |
|
AVKLNKQQTD |
|
IAVNWAGGLH |
|
HAKKSEASGF |
| CYVNDIVLAI |
|
LELLKYHQRV |
|
LYIDIDIHHG |
|
DGVEEAFYTT |
|
DRVMTVSFHK |
| YGEYFPGTGD |
|
LRDIGAGKGK |
|
YYAVNYPLRD |
|
GIDDESYEAI |
|
FKPVMSKVME |
| MFQPSAVVLQ |
|
CGSDSLSGDR |
|
LGCFNLTIKG |
|
HAKCVEFVKS |
|
FNLPMLMLGG |
| GGYTIRNVAR |
|
CWTYETAVAL |
|
DTEIPNELPY |
|
NDYFEYFGPD |
|
FKLHISPSNM |
| TNQNTNEYLE |
|
KIKQRLFENL |
|
RMLPHAPGVQ |
|
MQAIPEDAIP |
|
EESGDEDEDD |
| PDKRISICSS |
|
DKRIACEEEF |
|
SDSEEEGEGG |
|
RKNSSNFKKA |
|
KRVKTEDEKE |
| KDPEEKKEVT |
|
EEEKTKEEKP |
|
EAKGVKEEVK |
|
LA |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину.
Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми.
Локалізований у ядрі.
Література
-
Taunton J., Hassig C.A., Schreiber S.L. (1996). A mammalian histone deacetylase related to the yeast transcriptional regulator Rpd3p.. Science 272: 408 — 411. PubMed DOI:10.1126/science.272.5260.408
-
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
-
Cai R.L., Yan-Neale Y., Cueto M.A., Xu H., Cohen D. (2000). HDAC1, a histone deacetylase, forms a complex with Hus1 and Rad9, two G2/M checkpoint Rad proteins.. J. Biol. Chem. 275: 27909 — 27916. PubMed DOI:10.1074/jbc.M000168200
-
Wei L.-N., Hu X., Chandra D., Seto E., Farooqui M. (2000). Receptor-interacting protein 140 directly recruits histone deacetylases for gene silencing.. J. Biol. Chem. 275: 40782 — 40787. PubMed DOI:10.1074/jbc.M004821200
-
Zhou X., Richon V.M., Rifkind R.A., Marks P.A. (2000). Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 1056 — 1061. PubMed DOI:10.1073/pnas.97.3.1056
-
Pflum M.K.H., Tong J.K., Lane W.S., Schreiber S.L. (2001). Histone deacetylase 1 phosphorylation promotes enzymatic activity and complex formation.. J. Biol. Chem. 276: 47733 — 47741. PubMed DOI:10.1074/jbc.M105590200
Див. також