| NANOG
|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|
Символи
|
NANOG, entrez:79923, Nanog, Nanog homeobox |
| Зовнішні ІД |
OMIM: 607937 MGI: 1919200 HomoloGene: 78027 GeneCards: NANOG
|
| Онтологія гена |
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
| Клітинна компонента |
• Ядерце • клітинне ядро • Нуклеоплазма
|
| Біологічний процес |
• Регуляція експресії генів • regulation of cell differentiation • multicellular organism development • Диференціація клітин • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • endodermal cell fate specification • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • stem cell population maintenance • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of stem cell proliferation
|
| Джерела:Amigo / QuickGO
|
|
| Шаблон експресії
|
 |
|
Більше даних
|
| Ортологи |
| Види |
Людина |
Миша |
| Entrez |
|
|
| Ensembl |
|
|
| UniProt |
|
|
| RefSeq (мРНК) |
|
|
| RefSeq (білок) |
|
|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 7.79 – 7.8 Mb
|
Хр. 6: 122.68 – 122.69 Mb
|
|
PubMed search |
|
|
| Вікідані |
|
NANOG (англ. Nanog homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 305 амінокислот, а молекулярна маса — 34 620.
Послідовність амінокислот
| 10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
| MSVDPACPQS |
|
LPCFEASDCK |
|
ESSPMPVICG |
|
PEENYPSLQM |
|
SSAEMPHTET |
| VSPLPSSMDL |
|
LIQDSPDSST |
|
SPKGKQPTSA |
|
EKSVAKKEDK |
|
VPVKKQKTRT |
| VFSSTQLCVL |
|
NDRFQRQKYL |
|
SLQQMQELSN |
|
ILNLSYKQVK |
|
TWFQNQRMKS |
| KRWQKNNWPK |
|
NSNGVTQKAS |
|
APTYPSLYSS |
|
YHQGCLVNPT |
|
GNLPMWSNQT |
| WNNSTWSNQT |
|
QNIQSWSNHS |
|
WNTQTWCTQS |
|
WNNQAWNSPF |
|
YNCGEESLQS |
| CMQFQPNSPA |
|
SDLEAALEAA |
|
GEGLNVIQQT |
|
TRYFSTPQTM |
|
DLFLNYSMNM |
| QPEDV |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
-
Hart A.H., Hartley L., Ibrahim M., Robb L. (2004). Identification, cloning and expression analysis of the pluripotency promoting Nanog genes in mouse and human.. Dev. Dyn. 230: 187 — 198. PubMed DOI:10.1002/dvdy.20034
-
Booth H.A., Holland P.W. (2004). Eleven daughters of NANOG.. Genomics 84: 229 — 238. PubMed DOI:10.1016/j.ygeno.2004.02.014
Див. також
|
|
|
|
|
(1) Основні домени
|
|
|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
|
|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
|
| (1.4) NF-1 |
|
|
| (1.5) RF-X |
|
|
|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
|
|
|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК
|
|
|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
|
| підродина 1 |
|
|
| підродина 2 |
|
|
| підродина 3 |
|
|
| підродина 4 |
|
|
| підродина 5 |
|
|
| підродина 6 |
|
|
| підродина 0 |
|
|
|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
|
|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
|
|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
|
| (2.6) WRKY |
|
|
|
|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
|
|
|
|
(3.1) Гомеобокс
|
|
|
| (3.2) Парний бокс |
|
|
|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
|
|
(3.4) Фактори теплового шоку |
|
|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
|
|
|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
|
|
|
|
(4.1) RHR |
|
|
|
(4.2) STAT |
|
|
| (4.3) p53 |
|
|
|
(4.4) MADS |
|
|
|
(4.6) TATA |
|
|
| (4.7) Високомобільна група |
|
|
| (4.9) Grainyhead |
|
|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
|
| (4.11) Runt |
|
|
|
|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції
|
|
|
| (0.2) HMGI(Y) |
|
|
| (0.3) Pocket домен |
|
|
|
(0.5) AP2/EREBP-подібні
|
|
|
| (0.6) Інші |
|
|
|
|