SLITRK1
Подписчиков: 0, рейтинг: 0
SLITRK1 (англ. SLIT and NTRK like family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 696 амінокислот, а молекулярна маса — 77 735.
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLLWILLLET | SLCFAAGNVT | GDVCKEKICS | CNEIEGDLHV | DCEKKGFTSL | ||||
| QRFTAPTSQF | YHLFLHGNSL | TRLFPNEFAN | FYNAVSLHME | NNGLHEIVPG | ||||
| AFLGLQLVKR | LHINNNKIKS | FRKQTFLGLD | DLEYLQADFN | LLRDIDPGAF | ||||
| QDLNKLEVLI | LNDNLISTLP | ANVFQYVPIT | HLDLRGNRLK | TLPYEEVLEQ | ||||
| IPGIAEILLE | DNPWDCTCDL | LSLKEWLENI | PKNALIGRVV | CEAPTRLQGK | ||||
| DLNETTEQDL | CPLKNRVDSS | LPAPPAQEET | FAPGPLPTPF | KTNGQEDHAT | ||||
| PGSAPNGGTK | IPGNWQIKIR | PTAAIATGSS | RNKPLANSLP | CPGGCSCDHI | ||||
| PGSGLKMNCN | NRNVSSLADL | KPKLSNVQEL | FLRDNKIHSI | RKSHFVDYKN | ||||
| LILLDLGNNN | IATVENNTFK | NLLDLRWLYM | DSNYLDTLSR | EKFAGLQNLE | ||||
| YLNVEYNAIQ | LILPGTFNAM | PKLRILILNN | NLLRSLPVDV | FAGVSLSKLS | ||||
| LHNNYFMYLP | VAGVLDQLTS | IIQIDLHGNP | WECSCTIVPF | KQWAERLGSE | ||||
| VLMSDLKCET | PVNFFRKDFM | LLSNDEICPQ | LYARISPTLT | SHSKNSTGLA | ||||
| ETGTHSNSYL | DTSRVSISVL | VPGLLLVFVT | SAFTVVGMLV | FILRNRKRSK | ||||
| RRDANSSASE | INSLQTVCDS | SYWHNGPYNA | DGAHRVYDCG | SHSLSD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, синапсах. Також секретований назовні.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins.. DNA Res. 8: 179 — 187. PubMed DOI:10.1093/dnares/8.4.179
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Aruga J., Yokota N., Mikoshiba K. (2003). Human SLITRK family genes: genomic organization and expression profiling in normal brain and brain tumor tissue.. Gene 315: 87 — 94. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(03)00715-7
- Kajiwara Y., Buxbaum J.D., Grice D.E. (2009). SLITRK1 binds 14-3-3 and regulates neurite outgrowth in a phosphorylation-dependent manner.. Biol. Psychiatry 66: 918 — 925. PubMed DOI:10.1016/j.biopsych.2009.05.033
- Beaubien F., Raja R., Kennedy T.E., Fournier A.E., Cloutier J.F. (2016). Slitrk1 is localized to excitatory synapses and promotes their development.. Sci. Rep. 6: 27343 — 27343. PubMed DOI:10.1038/srep27343