| STAT1
|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|
Символи
|
STAT1, CANDF7, IMD31A, IMD31B, IMD31C, ISGF-3, STAT91, signal transducer and activator of transcription 1 |
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600555 MGI: 103063 HomoloGene: 21428 GeneCards: STAT1
|
| Онтологія гена |
| Молекулярна функція |
• DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • signal transducer activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • tumor necrosis factor receptor binding • double-stranded DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • cadherin binding • histone acetyltransferase binding • GO:0031493 histone binding • ubiquitin-like protein ligase binding • promoter-specific chromatin binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • CCR5 chemokine receptor binding • protein phosphatase 2A binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • Нуклеоплазма • Ядерце • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • гіалоплазма • Аксон • Дендрит (нейробіологія) • GO:0009327 protein-containing complex
|
| Біологічний процес |
• regulation of apoptotic process • metanephric mesenchymal cell proliferation involved in metanephros development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to interferon-beta • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • metanephric mesenchymal cell differentiation • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • renal tubule development • response to interferon-beta • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • transcription, DNA-templated • negative regulation of endothelial cell proliferation • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • negative regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation • negative regulation of angiogenesis • negative regulation by virus of viral protein levels in host cell • GO:0022415 viral process • endothelial cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 Сигнальна трансдукція • macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of erythrocyte differentiation • type I interferon signaling pathway • cellular response to interferon-gamma • positive regulation of defense response to virus by host • positive regulation of interferon-alpha production • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • defense response to virus • interferon-gamma-mediated signaling pathway • receptor signaling pathway via JAK-STAT • response to nutrient • кровообіг • positive regulation of cell population proliferation • response to mechanical stimulus • GO:1904578 response to organic cyclic compound • cellular response to insulin stimulus • response to cytokine • response to hydrogen peroxide • response to peptide hormone • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • response to cAMP • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • cellular response to cytokine stimulus • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of transcription of Notch receptor target • cytokine-mediated signaling pathway • interleukin-21-mediated signaling pathway • interleukin-6-mediated signaling pathway • interleukin-27-mediated signaling pathway • interleukin-35-mediated signaling pathway • interleukin-9-mediated signaling pathway • defense response • regulation of cell population proliferation
|
| Джерела:Amigo / QuickGO
|
|
| Шаблон експресії
|
 |
|
Більше даних
|
| Ортологи |
| Види |
Людина |
Миша |
| Entrez |
|
|
| Ensembl |
|
|
| UniProt |
|
|
| RefSeq (мРНК) |
|
|
| RefSeq (білок) |
|
|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 190.91 – 191.02 Mb
|
Хр. 1: 52.16 – 52.2 Mb
|
|
PubMed search |
|
|
| Вікідані |
|
STAT1 (англ. Signal transducer and activator of transcription 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 750 амінокислот, а молекулярна маса — 87 335.
Послідовність амінокислот
| 10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
| MSQWYELQQL |
|
DSKFLEQVHQ |
|
LYDDSFPMEI |
|
RQYLAQWLEK |
|
QDWEHAANDV |
| SFATIRFHDL |
|
LSQLDDQYSR |
|
FSLENNFLLQ |
|
HNIRKSKRNL |
|
QDNFQEDPIQ |
| MSMIIYSCLK |
|
EERKILENAQ |
|
RFNQAQSGNI |
|
QSTVMLDKQK |
|
ELDSKVRNVK |
| DKVMCIEHEI |
|
KSLEDLQDEY |
|
DFKCKTLQNR |
|
EHETNGVAKS |
|
DQKQEQLLLK |
| KMYLMLDNKR |
|
KEVVHKIIEL |
|
LNVTELTQNA |
|
LINDELVEWK |
|
RRQQSACIGG |
| PPNACLDQLQ |
|
NWFTIVAESL |
|
QQVRQQLKKL |
|
EELEQKYTYE |
|
HDPITKNKQV |
| LWDRTFSLFQ |
|
QLIQSSFVVE |
|
RQPCMPTHPQ |
|
RPLVLKTGVQ |
|
FTVKLRLLVK |
| LQELNYNLKV |
|
KVLFDKDVNE |
|
RNTVKGFRKF |
|
NILGTHTKVM |
|
NMEESTNGSL |
| AAEFRHLQLK |
|
EQKNAGTRTN |
|
EGPLIVTEEL |
|
HSLSFETQLC |
|
QPGLVIDLET |
| TSLPVVVISN |
|
VSQLPSGWAS |
|
ILWYNMLVAE |
|
PRNLSFFLTP |
|
PCARWAQLSE |
| VLSWQFSSVT |
|
KRGLNVDQLN |
|
MLGEKLLGPN |
|
ASPDGLIPWT |
|
RFCKENINDK |
| NFPFWLWIES |
|
ILELIKKHLL |
|
PLWNDGCIMG |
|
FISKERERAL |
|
LKDQQPGTFL |
| LRFSESSREG |
|
AITFTWVERS |
|
QNGGEPDFHA |
|
VEPYTKKELS |
|
AVTFPDIIRN |
| YKVMAAENIP |
|
ENPLKYLYPN |
|
IDKDHAFGKY |
|
YSRPKEAPEP |
|
MELDGPKGTG |
| YIKTELISVS |
|
EVHPSRLQTT |
|
DNLLPMSPEE |
|
FDEVSRIVGS |
|
VEFDSMMNTV |
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, антивірусний захист, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
-
Schindler C., Fu X.-Y., Improta T., Aebersold R., Darnell J.E. Jr. (1992). Proteins of transcription factor ISGF-3: one gene encodes the 91- and 84-kDa ISGF-3 proteins that are activated by interferon alpha.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 7836 — 7839. PubMed DOI:10.1073/pnas.89.16.7836
-
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
-
Yan R., Qureshi S., Zhong Z., Wen Z., Darnell J.E. Jr. (1995). The genomic structure of the STAT genes: multiple exons in coincident sites in Stat1 and Stat2.. Nucleic Acids Res. 23: 459 — 463. PubMed DOI:10.1093/nar/23.3.459
-
Fu X.Y. (1992). A transcription factor with SH2 and SH3 domains is directly activated by an interferon alpha-induced cytoplasmic protein tyrosine kinase(s).. Cell 70: 323 — 335. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(92)90106-M
-
Wen Z., Zhong Z., Darnell J.E. Jr. (1995). Maximal activation of transcription by Stat1 and Stat3 requires both tyrosine and serine phosphorylation.. Cell 82: 241 — 250. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(95)90311-9
-
Li X., Leung S., Kerr I.M., Stark G.R. (1997). Functional subdomains of STAT2 required for preassociation with the alpha interferon receptor and for signaling.. Mol. Cell. Biol. 17: 2048 — 2056. PubMed DOI:10.1128/MCB.17.4.2048
Див. також
|
|
|
|
|
(1) Основні домени
|
|
|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
|
|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
|
| (1.4) NF-1 |
|
|
| (1.5) RF-X |
|
|
|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
|
|
|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК
|
|
|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
|
| підродина 1 |
|
|
| підродина 2 |
|
|
| підродина 3 |
|
|
| підродина 4 |
|
|
| підродина 5 |
|
|
| підродина 6 |
|
|
| підродина 0 |
|
|
|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
|
|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
|
|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
|
| (2.6) WRKY |
|
|
|
|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
|
|
|
|
(3.1) Гомеобокс
|
|
|
| (3.2) Парний бокс |
|
|
|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
|
|
(3.4) Фактори теплового шоку |
|
|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
|
|
|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
|
|
|
|
(4.1) RHR |
|
|
|
(4.2) STAT |
|
|
| (4.3) p53 |
|
|
|
(4.4) MADS |
|
|
|
(4.6) TATA |
|
|
| (4.7) Високомобільна група |
|
|
| (4.9) Grainyhead |
|
|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
|
| (4.11) Runt |
|
|
|
|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції
|
|
|
| (0.2) HMGI(Y) |
|
|
| (0.3) Pocket домен |
|
|
|
(0.5) AP2/EREBP-подібні
|
|
|
| (0.6) Інші |
|
|
|
|