AFF2 (англ. AF4/FMR2 family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 311 амінокислот, а молекулярна маса — 144 771.
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MDLFDFFRDW | DLEQQCHYEQ | DRSALKKREW | ERRNQEVQQE | DDLFSSGFDL | ||||
| FGEPYKVAEY | TNKGDALANR | VQNTLGNYDE | MKNLLTNHSN | QNHLVGIPKN | ||||
| SVPQNPNNKN | EPSFFPEQKN | RIIPPHQDNT | HPSAPMPPPS | VVILNSTLIH | ||||
| SNRKSKPEWS | RDSHNPSTVL | ASQASGQPNK | MQTLTQDQSQ | AKLEDFFVYP | ||||
| AEQPQIGEVE | ESNPSAKEDS | NPNSSGEDAF | KEIFQSNSPE | ESEFAVQAPG | ||||
| SPLVASSLLA | PSSGLSVQNF | PPGLYCKTSM | GQQKPTAYVR | PMDGQDQAPD | ||||
| ISPTLKPSIE | FENSFGNLSF | GTLLDGKPSA | ASSKTKLPKF | TILQTSEVSL | ||||
| PSDPSCVEEI | LREMTHSWPT | PLTSMHTAGH | SEQSTFSIPG | QESQHLTPGF | ||||
| TLQKWNDPTT | RASTKSVSFK | SMLEDDLKLS | SDEDDLEPVK | TLTTQCTATE | ||||
| LYQAVEKAKP | RNNPVNPPLA | TPQPPPAVQA | SGGSGSSSES | ESSSESDSDT | ||||
| ESSTTDSESN | EAPRVATPEP | EPPSTNKWQL | DKWLNKVTSQ | NKSFICGQNE | ||||
| TPMETISLPP | PIIQPMEVQM | KVKTNASQVP | AEPKERPLLS | LIREKARPRP | ||||
| TQKIPETKAL | KHKLSTTSET | VSQRTIGKKQ | PKKVEKNTST | DEFTWPKPNI | ||||
| TSSTPKEKES | VELHDPPRGR | NKATAHKPAP | RKEPRPNIPL | APEKKKYRGP | ||||
| GKIVPKSREF | IETDSSTSDS | NTDQEETLQI | KVLPPCIISG | GNTAKSKEIC | ||||
| GASLTLSTLM | SSSGSNNNLS | ISNEEPTFSP | IPVMQTEILS | PLRDHENLKN | ||||
| LWVKIDLDLL | SRVPGHSSLH | AAPAKPDHKE | TATKPKRQTA | VTAVEKPAPK | ||||
| GKRKHKPIEV | AEKIPEKKQR | LEEATTICLL | PPCISPAPPH | KPPNTRENNS | ||||
| SRRANRRKEE | KLFPPPLSPL | PEDPPRRRNV | SGNNGPFGQD | KNIAMTGQIT | ||||
| STKPKRTEGK | FCATFKGISV | NEGDTPKKAS | SATITVTNTA | IATATVTATA | ||||
| IVTTTVTATA | TATATTTTTT | TTISTITSTI | TTGLMDSSHL | EMTSWAALPL | ||||
| LSSSSTNVRR | PKLTFDDSVH | NADYYMQEAK | KLKHKADALF | EKFGKAVNYA | ||||
| DAALSFTECG | NAMERDPLEA | KSPYTMYSET | VELLRYAMRL | KNFASPLASD | ||||
| GDKKLAVLCY | RCLSLLYLRM | FKLKKDHAMK | YSRSLMEYFK | QNASKVAQIP | ||||
| SPWVSNGKNT | PSPVSLNNVS | PINAMGNCNN | GPVTIPQRIH | HMAASHVNIT | ||||
| SNVLRGYEHW | DMADKLTREN | KEFFGDLDTL | MGPLTQHSSM | TNLVRYVRQG | ||||
| LCWLRIDAHL | L |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Gecz J., Gedeon A.K., Sutherland G.R., Mulley J.C. (1996). Identification of the gene FMR2, associated with FRAXE mental retardation.. Nat. Genet. 13: 105 — 108. PubMed DOI:10.1038/ng0596-105
- Gu Y., Shen Y., Gibbs R.A., Nelson D.L. (1996). Identification of FMR2, a novel gene associated with the FRAXE CCG repeat and CpG island.. Nat. Genet. 13: 109 — 113. PubMed DOI:10.1038/ng0596-109
- Chakrabarti L., Knight S.J.L., Flannery A.V., Davies K.E. (1996). A candidate gene for mild mental handicap at the FRAXE fragile site.. Hum. Mol. Genet. 5: 275 — 282. PubMed DOI:10.1093/hmg/5.2.275
- Gecz J., Bielby S., Sutherland G.R., Mulley J.C. (1997). Gene structure and subcellular localization of FMR2, a member of a new family of putative transcription activators.. Genomics 44: 201 — 213. PubMed DOI:10.1006/geno.1997.4867
- Chakrabarti L., Bristulf J., Foss G.S., Davies K.E. (1998). Expression of the murine homologue of FMR2 in mouse brain and during development.. Hum. Mol. Genet. 7: 441 — 448. PubMed DOI:10.1093/hmg/7.3.441
- Kitano T., Schwarz C., Nickel B., Paeaebo S. (2003). Gene diversity patterns at 10 X-chromosomal loci in humans and chimpanzees.. Mol. Biol. Evol. 20: 1281 — 1289. PubMed DOI:10.1093/molbev/msg134