| AHR
|
|
| Ідентифікатори
|
|
Символи
|
AHR, bHLHe76, aryl hydrocarbon receptor, Aryl hydrocarbon receptor, RP85 |
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600253 MGI: 105043 HomoloGene: 1224 GeneCards: AHR
|
| Онтологія гена |
| Молекулярна функція |
• DNA binding • Hsp90 protein binding • protein dimerization activity • transcription factor binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • TFIID-class transcription factor complex binding • transcription coactivator binding • TBP-class protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • sequence-specific double-stranded DNA binding
|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • transcription regulator complex • cytosolic aryl hydrocarbon receptor complex • nuclear aryl hydrocarbon receptor complex • клітинне ядро • aryl hydrocarbon receptor complex • гіалоплазма • Нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of B cell proliferation • blood vessel development • Регуляція експресії генів • xenobiotic metabolic process • клітинний цикл • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • response to toxic substance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0097285 Апоптоз • intracellular receptor signaling pathway • GO:1901555, GO:1905705 response to drug • cAMP-mediated signaling • cellular response to cAMP • cellular response to forskolin • cellular response to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine
|
| Джерела:Amigo / QuickGO
|
|
| Ортологи |
| Види |
Людина |
Миша |
| Entrez |
|
|
| Ensembl |
|
|
| UniProt |
|
|
| RefSeq (мРНК) |
|
|
| RefSeq (білок) |
|
|
| Локус (UCSC) |
Хр. 7: 16.92 – 17.35 Mb
|
Хр. 12: 35.55 – 35.59 Mb
|
|
PubMed search |
|
|
| Вікідані |
|
AHR (англ. Aryl hydrocarbon receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 848 амінокислот, а молекулярна маса — 96 147.
Послідовність амінокислот
| 10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
| MNSSSANITY |
|
ASRKRRKPVQ |
|
KTVKPIPAEG |
|
IKSNPSKRHR |
|
DRLNTELDRL |
| ASLLPFPQDV |
|
INKLDKLSVL |
|
RLSVSYLRAK |
|
SFFDVALKSS |
|
PTERNGGQDN |
| CRAANFREGL |
|
NLQEGEFLLQ |
|
ALNGFVLVVT |
|
TDALVFYASS |
|
TIQDYLGFQQ |
| SDVIHQSVYE |
|
LIHTEDRAEF |
|
QRQLHWALNP |
|
SQCTESGQGI |
|
EEATGLPQTV |
| VCYNPDQIPP |
|
ENSPLMERCF |
|
ICRLRCLLDN |
|
SSGFLAMNFQ |
|
GKLKYLHGQK |
| KKGKDGSILP |
|
PQLALFAIAT |
|
PLQPPSILEI |
|
RTKNFIFRTK |
|
HKLDFTPIGC |
| DAKGRIVLGY |
|
TEAELCTRGS |
|
GYQFIHAADM |
|
LYCAESHIRM |
|
IKTGESGMIV |
| FRLLTKNNRW |
|
TWVQSNARLL |
|
YKNGRPDYII |
|
VTQRPLTDEE |
|
GTEHLRKRNT |
| KLPFMFTTGE |
|
AVLYEATNPF |
|
PAIMDPLPLR |
|
TKNGTSGKDS |
|
ATTSTLSKDS |
| LNPSSLLAAM |
|
MQQDESIYLY |
|
PASSTSSTAP |
|
FENNFFNESM |
|
NECRNWQDNT |
| APMGNDTILK |
|
HEQIDQPQDV |
|
NSFAGGHPGL |
|
FQDSKNSDLY |
|
SIMKNLGIDF |
| EDIRHMQNEK |
|
FFRNDFSGEV |
|
DFRDIDLTDE |
|
ILTYVQDSLS |
|
KSPFIPSDYQ |
| QQQSLALNSS |
|
CMVQEHLHLE |
|
QQQQHHQKQV |
|
VVEPQQQLCQ |
|
KMKHMQVNGM |
| FENWNSNQFV |
|
PFNCPQQDPQ |
|
QYNVFTDLHG |
|
ISQEFPYKSE |
|
MDSMPYTQNF |
| ISCNQPVLPQ |
|
HSKCTELDYP |
|
MGSFEPSPYP |
|
TTSSLEDFVT |
|
CLQLPENQKH |
| GLNPQSAIIT |
|
PQTCYAGAVS |
|
MYQCQPEPQH |
|
THVGQMQYNP |
|
VLPGQQAFLN |
| KFQNGVLNET |
|
YPAELNNINN |
|
TQTTTHLQPL |
|
HHPSEARPFP |
|
DLTSSGFL |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біологічні ритми, ацетилювання.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
-
Itoh S., Kamataki T. (1993). Human Ah receptor cDNA: analysis for highly conserved sequences.. Nucleic Acids Res. 21: 3578 — 3578. PubMed DOI:10.1093/nar/21.15.3578
-
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
-
Bennett P., Ramsden D.B., Williams A.C. (1996). Complete structural characterisation of the human aryl hydrocarbon receptor gene.. Clin. Mol. Pathol. 49: M12 — M16. PubMed DOI:10.1136/mp.49.1.M12
-
Nguyen T.A., Hoivik D., Lee J.-E., Safe S. (1999). Interactions of nuclear receptor coactivator/corepressor proteins with the aryl hydrocarbon receptor complex.. Arch. Biochem. Biophys. 367: 250 — 257. PubMed DOI:10.1006/abbi.1999.1282
-
Puga A., Xia Y., Elferink C. (2002). Role of the aryl hydrocarbon receptor in cell cycle regulation.. Chem. Biol. Interact. 141: 117 — 130. PubMed DOI:10.1016/S0009-2797(02)00069-8
-
Antenos M., Casper R.F., Brown T.J. (2002). Interaction with Nedd8, a ubiquitin-like protein, enhances the transcriptional activity of the aryl hydrocarbon receptor.. J. Biol. Chem. 277: 44028 — 44034. PubMed DOI:10.1074/jbc.M202413200
Див. також
|
|
|
|
|
(1) Основні домени
|
|
|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
|
|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
|
| (1.4) NF-1 |
|
|
| (1.5) RF-X |
|
|
|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
|
|
|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК
|
|
|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
|
| підродина 1 |
|
|
| підродина 2 |
|
|
| підродина 3 |
|
|
| підродина 4 |
|
|
| підродина 5 |
|
|
| підродина 6 |
|
|
| підродина 0 |
|
|
|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
|
|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
|
|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
|
| (2.6) WRKY |
|
|
|
|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
|
|
|
|
(3.1) Гомеобокс
|
|
|
| (3.2) Парний бокс |
|
|
|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
|
|
(3.4) Фактори теплового шоку |
|
|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
|
|
|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
|
|
|
|
(4.1) RHR |
|
|
|
(4.2) STAT |
|
|
| (4.3) p53 |
|
|
|
(4.4) MADS |
|
|
|
(4.6) TATA |
|
|
| (4.7) Високомобільна група |
|
|
| (4.9) Grainyhead |
|
|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
|
| (4.11) Runt |
|
|
|
|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції
|
|
|
| (0.2) HMGI(Y) |
|
|
| (0.3) Pocket домен |
|
|
|
(0.5) AP2/EREBP-подібні
|
|
|
| (0.6) Інші |
|
|
|
|