APOBEC3G (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 384 амінокислот, а молекулярна маса — 46 408. Цей білок належить до родини цитидиндезаміназ, його ген у приматів та людини знаходиться у кластері генів APOBEC3.
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MKPHFRNTVE | RMYRDTFSYN | FYNRPILSRR | NTVWLCYEVK | TKGPSRPPLD | ||||
| AKIFRGQVYS | ELKYHPEMRF | FHWFSKWRKL | HRDQEYEVTW | YISWSPCTKC | ||||
| TRDMATFLAE | DPKVTLTIFV | ARLYYFWDPD | YQEALRSLCQ | KRDGPRATMK | ||||
| IMNYDEFQHC | WSKFVYSQRE | LFEPWNNLPK | YYILLHIMLG | EILRHSMDPP | ||||
| TFTFNFNNEP | WVRGRHETYL | CYEVERMHND | TWVLLNQRRG | FLCNQAPHKH | ||||
| GFLEGRHAEL | CFLDVIPFWK | LDLDQDYRVT | CFTSWSPCFS | CAQEMAKFIS | ||||
| KNKHVSLCIF | TARIYDDQGR | CQEGLRTLAE | AGAKISIMTY | SEFKHCWDTF | ||||
| VDHQGCPFQP | WDGLDEHSQD | LSGRLRAILQ | NQEN |
Задіяний у таких біологічних процесах як вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист. Відповідає за дезамінування цидитиинів ДНК ретровірусів, вірусу гепатиту B, ретротранспозонів.
Білок має сайт для зв'язування з іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
APOBEC3G присутній у багатьох тканинах і клітинах, зокрема в T-лімфоцитах. Цей білок уперше було відкрито завдяки його взаємодії із білком Vif вірусу імунодефіциту людини.
У 2016 році було виявлено, що чимало генетичних відмінностей між послідовністю ДНК людини та людиноподібних мавп визначається локусами, подібними до тих, що редагує APOBEC3G.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Sheehy A.M., Gaddis N.C., Choi J.D., Malim M.H. (2002). Isolation of a human gene that inhibits HIV-1 infection and is suppressed by the viral Vif protein.. Nature 418: 646 — 650. PubMed DOI:10.1038/nature00939
- Stopak K., de Noronha C., Yonemoto W., Greene W.C. (2003). HIV-1 Vif blocks the antiviral activity of APOBEC3G by impairing both its translation and intracellular stability.. Mol. Cell 12: 591 — 601. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(03)00353-8
- Marin M., Rose K.M., Kozak S.L., Kabat D. (2003). HIV-1 Vif protein binds the editing enzyme APOBEC3G and induces its degradation.. Nat. Med. 9: 1398 — 1403. PubMed DOI:10.1038/nm946
- Sheehy A.M., Gaddis N.C., Malim M.H. (2003). The antiretroviral enzyme APOBEC3G is degraded by the proteasome in response to HIV-1 Vif.. Nat. Med. 9: 1404 — 1407. PubMed DOI:10.1038/nm945
- Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business.. Trends Genet. 19: 207 — 216. PubMed DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4