DYSF
Другие языки:
DYSF
Подписчиков: 0, рейтинг: 0
DYSF (англ. Dysferlin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 080 амінокислот, а молекулярна маса — 237 295.
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLRVFILYAE | NVHTPDTDIS | DAYCSAVFAG | VKKRTKVIKN | SVNPVWNEGF | ||||
| EWDLKGIPLD | QGSELHVVVK | DHETMGRNRF | LGEAKVPLRE | VLATPSLSAS | ||||
| FNAPLLDTKK | QPTGASLVLQ | VSYTPLPGAV | PLFPPPTPLE | PSPTLPDLDV | ||||
| VADTGGEEDT | EDQGLTGDEA | EPFLDQSGGP | GAPTTPRKLP | SRPPPHYPGI | ||||
| KRKRSAPTSR | KLLSDKPQDF | QIRVQVIEGR | QLPGVNIKPV | VKVTAAGQTK | ||||
| RTRIHKGNSP | LFNETLFFNL | FDSPGELFDE | PIFITVVDSR | SLRTDALLGE | ||||
| FRMDVGTIYR | EPRHAYLRKW | LLLSDPDDFS | AGARGYLKTS | LCVLGPGDEA | ||||
| PLERKDPSED | KEDIESNLLR | PTGVALRGAH | FCLKVFRAED | LPQMDDAVMD | ||||
| NVKQIFGFES | NKKNLVDPFV | EVSFAGKMLC | SKILEKTANP | QWNQNITLPA | ||||
| MFPSMCEKMR | IRIIDWDRLT | HNDIVATTYL | SMSKISAPGG | EIEEEPAGAV | ||||
| KPSKASDLDD | YLGFLPTFGP | CYINLYGSPR | EFTGFPDPYT | ELNTGKGEGV | ||||
| AYRGRLLLSL | ETKLVEHSEQ | KVEDLPADDI | LRVEKYLRRR | KYSLFAAFYS | ||||
| ATMLQDVDDA | IQFEVSIGNY | GNKFDMTCLP | LASTTQYSRA | VFDGCHYYYL | ||||
| PWGNVKPVVV | LSSYWEDISH | RIETQNQLLG | IADRLEAGLE | QVHLALKAQC | ||||
| STEDVDSLVA | QLTDELIAGC | SQPLGDIHET | PSATHLDQYL | YQLRTHHLSQ | ||||
| ITEAALALKL | GHSELPAALE | QAEDWLLRLR | ALAEEPQNSL | PDIVIWMLQG | ||||
| DKRVAYQRVP | AHQVLFSRRG | ANYCGKNCGK | LQTIFLKYPM | EKVPGARMPV | ||||
| QIRVKLWFGL | SVDEKEFNQF | AEGKLSVFAE | TYENETKLAL | VGNWGTTGLT | ||||
| YPKFSDVTGK | IKLPKDSFRP | SAGWTWAGDW | FVCPEKTLLH | DMDAGHLSFV | ||||
| EEVFENQTRL | PGGQWIYMSD | NYTDVNGEKV | LPKDDIECPL | GWKWEDEEWS | ||||
| TDLNRAVDEQ | GWEYSITIPP | ERKPKHWVPA | EKMYYTHRRR | RWVRLRRRDL | ||||
| SQMEALKRHR | QAEAEGEGWE | YASLFGWKFH | LEYRKTDAFR | RRRWRRRMEP | ||||
| LEKTGPAAVF | ALEGALGGVM | DDKSEDSMSV | STLSFGVNRP | TISCIFDYGN | ||||
| RYHLRCYMYQ | ARDLAAMDKD | SFSDPYAIVS | FLHQSQKTVV | VKNTLNPTWD | ||||
| QTLIFYEIEI | FGEPATVAEQ | PPSIVVELYD | HDTYGADEFM | GRCICQPSLE | ||||
| RMPRLAWFPL | TRGSQPSGEL | LASFELIQRE | KPAIHHIPGF | EVQETSRILD | ||||
| ESEDTDLPYP | PPQREANIYM | VPQNIKPALQ | RTAIEILAWG | LRNMKSYQLA | ||||
| NISSPSLVVE | CGGQTVQSCV | IRNLRKNPNF | DICTLFMEVM | LPREELYCPP | ||||
| ITVKVIDNRQ | FGRRPVVGQC | TIRSLESFLC | DPYSAESPSP | QGGPDDVSLL | ||||
| SPGEDVLIDI | DDKEPLIPIQ | EEEFIDWWSK | FFASIGEREK | CGSYLEKDFD | ||||
| TLKVYDTQLE | NVEAFEGLSD | FCNTFKLYRG | KTQEETEDPS | VIGEFKGLFK | ||||
| IYPLPEDPAI | PMPPRQFHQL | AAQGPQECLV | RIYIVRAFGL | QPKDPNGKCD | ||||
| PYIKISIGKK | SVSDQDNYIP | CTLEPVFGKM | FELTCTLPLE | KDLKITLYDY | ||||
| DLLSKDEKIG | ETVVDLENRL | LSKFGARCGL | PQTYCVSGPN | QWRDQLRPSQ | ||||
| LLHLFCQQHR | VKAPVYRTDR | VMFQDKEYSI | EEIEAGRIPN | PHLGPVEERL | ||||
| ALHVLQQQGL | VPEHVESRPL | YSPLQPDIEQ | GKLQMWVDLF | PKALGRPGPP | ||||
| FNITPRRARR | FFLRCIIWNT | RDVILDDLSL | TGEKMSDIYV | KGWMIGFEEH | ||||
| KQKTDVHYRS | LGGEGNFNWR | FIFPFDYLPA | EQVCTIAKKD | AFWRLDKTES | ||||
| KIPARVVFQI | WDNDKFSFDD | FLGSLQLDLN | RMPKPAKTAK | KCSLDQLDDA | ||||
| FHPEWFVSLF | EQKTVKGWWP | CVAEEGEKKI | LAGKLEMTLE | IVAESEHEER | ||||
| PAGQGRDEPN | MNPKLEDPRR | PDTSFLWFTS | PYKTMKFILW | RRFRWAIILF | ||||
| IILFILLLFL | AIFIYAFPNY | AAMKLVKPFS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах.
Література
- Pramono Z.A.D., Lai P.S., Tan C.L., Takeda S., Yee W.C. (2006). Identification and characterization of a novel human dysferlin transcript: dysferlin_v1.. Hum. Genet. 120: 410 — 419. PubMed DOI:10.1007/s00439-006-0230-1
- Davis D.B., Doherty K.R., Delmonte A.J., McNally E.M. (2002). Calcium-sensitive phospholipid binding properties of normal and mutant ferlin C2 domains.. J. Biol. Chem. 277: 22883 — 22888. PubMed DOI:10.1074/jbc.M201858200
- Abdullah N., Padmanarayana M., Marty N.J., Johnson C.P. (2014). Quantitation of the calcium and membrane binding properties of the c2 domains of dysferlin.. Biophys. J. 106: 382 — 389. PubMed DOI:10.1016/j.bpj.2013.11.4492
- Sula A., Cole A.R., Yeats C., Orengo C., Keep N.H. (2014). Crystal structures of the human Dysferlin inner DysF domain.. BMC Struct. Biol. 14: 3 — 3. PubMed DOI:10.1186/1472-6807-14-3
- Kawabe K., Goto K., Nishino I., Angelini C., Hayashi Y.K. (2004). Dysferlin mutation analysis in a group of Italian patients with limb-girdle muscular dystrophy and Miyoshi myopathy.. Eur. J. Neurol. 11: 657 — 661. PubMed DOI:10.1111/j.1468-1331.2004.00755.x
- Oh S.-H., Kim T.-S., Choi Y.-C. (2004). Identification of a dysferlin gene mutation in a Korean case with Miyoshi myopathy.. Yonsei Med. J. 45: 927 — 930. PubMed DOI:10.3349/ymj.2004.45.5.927