| FOS
|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|
Символи
|
FOS, AP-1, C-p55, Fos proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit |
| Зовнішні ІД |
OMIM: 164810 MGI: 95574 HomoloGene: 3844 GeneCards: FOS
|
| Онтологія гена |
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • R-SMAD binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • double-stranded DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • transcription regulator complex • Нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • neuron projection • клітинне ядро • protein-DNA complex • transcription factor AP-1 complex
|
| Біологічний процес |
• cellular response to extracellular stimulus • response to muscle stretch • response to immobilization stress • cellular response to calcium ion • response to cytokine • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • SMAD protein signal transduction • GO:1904578 response to organic cyclic compound • response to light stimulus • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to progesterone • female pregnancy • response to corticosterone • response to mechanical stimulus • GO:0010260 старіння людини • positive regulation of osteoclast differentiation • transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • response to gravity • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Метилювання ДНК • response to lipopolysaccharide • сон • cellular response to hormone stimulus • regulation of DNA-binding transcription factor activity • conditioned taste aversion • skeletal muscle cell differentiation • response to cold • response to cAMP • inflammatory response • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • response to toxic substance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Регуляція експресії генів • cytokine-mediated signaling pathway • cellular response to cadmium ion • positive regulation of neuron death
|
| Джерела:Amigo / QuickGO
|
|
| Шаблон експресії
|
 |
|
Більше даних
|
| Ортологи |
| Види |
Людина |
Миша |
| Entrez |
|
|
| Ensembl |
|
|
| UniProt |
|
|
| RefSeq (мРНК) |
|
|
| RefSeq (білок) |
|
|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 75.28 – 75.28 Mb
|
Хр. 12: 85.52 – 85.52 Mb
|
|
PubMed search |
|
|
| Вікідані |
|
FOS (англ. Fos proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 40 695.
Послідовність амінокислот
| 10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
| MMFSGFNADY |
|
EASSSRCSSA |
|
SPAGDSLSYY |
|
HSPADSFSSM |
|
GSPVNAQDFC |
| TDLAVSSANF |
|
IPTVTAISTS |
|
PDLQWLVQPA |
|
LVSSVAPSQT |
|
RAPHPFGVPA |
| PSAGAYSRAG |
|
VVKTMTGGRA |
|
QSIGRRGKVE |
|
QLSPEEEEKR |
|
RIRRERNKMA |
| AAKCRNRRRE |
|
LTDTLQAETD |
|
QLEDEKSALQ |
|
TEIANLLKEK |
|
EKLEFILAAH |
| RPACKIPDDL |
|
GFPEEMSVAS |
|
LDLTGGLPEV |
|
ATPESEEAFT |
|
LPLLNDPEPK |
| PSVEPVKSIS |
|
SMELKTEPFD |
|
DFLFPASSRP |
|
SGSETARSVP |
|
DMDLSGSFYA |
| ADWEPLHSGS |
|
LGMGPMATEL |
|
EPLCTPVVTC |
|
TPSCTAYTSS |
|
FVFTYPEADS |
| FPSCAAAHRK |
|
GSSSNEPSSD |
|
SLSSPTLLAL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
-
van Straaten F., Mueller R., Curran T., Van Beveren C., Verma I.M. (1983). Complete nucleotide sequence of a human c-onc gene: deduced amino acid sequence of the human c-fos protein.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 3183 — 3187. PubMed DOI:10.1073/pnas.80.11.3183
-
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
-
Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers.. Genes Dev. 3: 2083 — 2090. PubMed DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
-
Zhang Y., Feng X.H., Derynck R. (1998). Smad3 and Smad4 cooperate with c-Jun/c-Fos to mediate TGF-beta-induced transcription.. Nature 394: 909 — 913. PubMed DOI:10.1038/29814
-
Murphy L.O., Smith S., Chen R.H., Fingar D.C., Blenis J. (2002). Molecular interpretation of ERK signal duration by immediate early gene products.. Nat. Cell Biol. 4: 556 — 564. PubMed DOI:10.1038/ncb822
-
Portal M.M., Ferrero G.O., Caputto B.L. (2007). N-Terminal c-Fos tyrosine phosphorylation regulates c-Fos/ER association and c-Fos-dependent phospholipid synthesis activation.. Oncogene 26: 3551 — 3558. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1210137
Див. також
|
|
|
|
|
(1) Основні домени
|
|
|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
|
|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
|
| (1.4) NF-1 |
|
|
| (1.5) RF-X |
|
|
|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
|
|
|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК
|
|
|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
|
| підродина 1 |
|
|
| підродина 2 |
|
|
| підродина 3 |
|
|
| підродина 4 |
|
|
| підродина 5 |
|
|
| підродина 6 |
|
|
| підродина 0 |
|
|
|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
|
|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
|
|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
|
| (2.6) WRKY |
|
|
|
|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
|
|
|
|
(3.1) Гомеобокс
|
|
|
| (3.2) Парний бокс |
|
|
|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
|
|
(3.4) Фактори теплового шоку |
|
|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
|
|
|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
|
|
|
|
(4.1) RHR |
|
|
|
(4.2) STAT |
|
|
| (4.3) p53 |
|
|
|
(4.4) MADS |
|
|
|
(4.6) TATA |
|
|
| (4.7) Високомобільна група |
|
|
| (4.9) Grainyhead |
|
|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
|
| (4.11) Runt |
|
|
|
|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції
|
|
|
| (0.2) HMGI(Y) |
|
|
| (0.3) Pocket домен |
|
|
|
(0.5) AP2/EREBP-подібні
|
|
|
| (0.6) Інші |
|
|
|
|