FOXP2
|
|
|
Ідентифікатори
|
Символи
|
FOXP2, CAGH44, SPCH1, TNRC10, forkhead box P2 |
Зовнішні ІД |
OMIM: 605317 HomoloGene: 33482 GeneCards: FOXP2
|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
Developmental verbal dyspraxia
|
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • androgen receptor binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
Біологічний процес |
• positive regulation of epithelial cell proliferation involved in lung morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lung development • positive regulation of epithelial cell proliferation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • post-embryonic development • transcription, DNA-templated • cerebellum development • putamen development • vocal learning • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • smooth muscle tissue development • cerebral cortex development • caudate nucleus development • camera-type eye development • lung alveolus development • righting reflex • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • skeletal muscle tissue development • forebrain development • response to testosterone • innate vocalization behavior • anatomical structure morphogenesis • Диференціація клітин • growth
|
Джерела:Amigo / QuickGO
|
|
Шаблон експресії
|
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
Entrez |
|
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
|
|
RefSeq (білок) |
|
|
Локус (UCSC) |
Хр. 7: 114.09 – 114.69 Mb
|
н/д
|
PubMed search |
|
|
Вікідані |
|
FOXP2 (англ. Forkhead box P2) – білок, який кодується геном FOXP2, розташованим у людей на довгому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 715 амінокислот, а молекулярна маса — 79 919.
Послідовність амінокислот
10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
MMQESATETI |
|
SNSSMNQNGM |
|
STLSSQLDAG |
|
SRDGRSSGDT |
|
SSEVSTVELL |
HLQQQQALQA |
|
ARQLLLQQQT |
|
SGLKSPKSSD |
|
KQRPLQVPVS |
|
VAMMTPQVIT |
PQQMQQILQQ |
|
QVLSPQQLQA |
|
LLQQQQAVML |
|
QQQQLQEFYK |
|
KQQEQLHLQL |
LQQQQQQQQQ |
|
QQQQQQQQQQ |
|
QQQQQQQQQQ |
|
QQQQQQQQQQ |
|
QHPGKQAKEQ |
QQQQQQQQQL |
|
AAQQLVFQQQ |
|
LLQMQQLQQQ |
|
QHLLSLQRQG |
|
LISIPPGQAA |
LPVQSLPQAG |
|
LSPAEIQQLW |
|
KEVTGVHSME |
|
DNGIKHGGLD |
|
LTTNNSSSTT |
SSNTSKASPP |
|
ITHHSIVNGQ |
|
SSVLSARRDS |
|
SSHEETGASH |
|
TLYGHGVCKW |
PGCESICEDF |
|
GQFLKHLNNE |
|
HALDDRSTAQ |
|
CRVQMQVVQQ |
|
LEIQLSKERE |
RLQAMMTHLH |
|
MRPSEPKPSP |
|
KPLNLVSSVT |
|
MSKNMLETSP |
|
QSLPQTPTTP |
TAPVTPITQG |
|
PSVITPASVP |
|
NVGAIRRRHS |
|
DKYNIPMSSE |
|
IAPNYEFYKN |
ADVRPPFTYA |
|
TLIRQAIMES |
|
SDRQLTLNEI |
|
YSWFTRTFAY |
|
FRRNAATWKN |
AVRHNLSLHK |
|
CFVRVENVKG |
|
AVWTVDEVEY |
|
QKRRSQKITG |
|
SPTLVKNIPT |
SLGYGAALNA |
|
SLQAALAESS |
|
LPLLSNPGLI |
|
NNASSGLLQA |
|
VHEDLNGSLD |
HIDSNGNSSP |
|
GCSPQPHIHS |
|
IHVKEEPVIA |
|
EDEDCPMSLV |
|
TTANHSPELE |
DDREIEEEPL |
|
SEDLE |
Цей білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція транскрипції. Білок має сайти для зв'язування з іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
FOXP2 відповідає за розвиток мови людини та комунікації тварин, включаючи здатність відтворення граматичних конструкцій. Це один з білків родини факторів транскрипції FOX. Дослідження мутацій людини та миші вказують на те, що продукт цього гену залучений до регуляції експресії генів, залучених до розвитку таких органів як головний мозок, легені та травна система, проте точні функції гену залишаються предметом досліджень.
Література
-
Lai C.S.L., Fisher S.E., Hurst J.A., Vargha-Khadem F., Monaco A.P. (2001). A forkhead-domain gene is mutated in a severe speech and language disorder.. Nature 413: 519 — 523. PubMed DOI:10.1038/35097076
-
Bruce H.A., Margolis R.L. (2002). FOXP2: novel exons, splice variants, and CAG repeat length stability.. Hum. Genet. 111: 136 — 144. PubMed DOI:10.1007/s00439-002-0768-5
-
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
-
Teramitsu I., Kudo L.C., London S.E., Geschwind D.H., White S.A. (2004). Parallel FoxP1 and FoxP2 expression in songbird and human brain predicts functional interaction.. J. Neurosci. 24: 3152 — 3163. PubMed DOI:10.1523/JNEUROSCI.5589-03.2004
Див. також
|
|
(1) Основні домени
|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
|
(1.4) NF-1 |
|
|
(1.5) RF-X |
|
|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК
|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
|
підродина 1 |
|
|
підродина 2 |
|
|
підродина 3 |
|
|
підродина 4 |
|
|
підродина 5 |
|
|
підродина 6 |
|
|
підродина 0 |
|
|
|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
|
(2.6) WRKY |
|
|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
|
|
(3.1) Гомеобокс
|
|
|
(3.2) Парний бокс |
|
|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
|
(3.4) Фактори теплового шоку |
|
|
(3.5) Триптофановий кластер |
|
|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
|
|
(4.1) RHR |
|
|
(4.2) STAT |
|
|
(4.3) p53 |
|
|
(4.4) MADS |
|
|
(4.6) TATA |
|
|
(4.7) Високомобільна група |
|
|
(4.9) Grainyhead |
|
|
(4.10) Домен холодового шоку |
|
|
(4.11) Runt |
|
|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції
|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
|
(0.3) Pocket домен |
|
|
(0.5) AP2/EREBP-подібні
|
|
|
(0.6) Інші |
|
|
|
|