| GLI1
|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|
Символи
|
GLI1, GLI, GLI family zinc finger 1, PAPA8, PPD1 |
| Зовнішні ІД |
OMIM: 165220 MGI: 95727 HomoloGene: 3859 GeneCards: GLI1
|
| Онтологія гена |
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • microtubule binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • гіалоплазма • Війка • Нуклеоплазма • ciliary base • ciliary tip • GO:0035085 Аксонема • клітинне ядро
|
| Біологічний процес |
• epidermal cell differentiation • proximal/distal pattern formation • Диференціація клітин • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of smoothened signaling pathway • lung development • positive regulation of cell migration • smoothened signaling pathway involved in regulation of cerebellar granule cell precursor cell proliferation • notochord regression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA replication • ventral midline development • multicellular organism development • regulation of smoothened signaling pathway • liver regeneration • response to wounding • regulation of osteoblast differentiation • osteoblast differentiation • Сперматогенез • positive regulation of cell population proliferation • cerebellar cortex morphogenesis • regulation of hepatocyte proliferation • canonical Wnt signaling pathway • smoothened signaling pathway • dorsal/ventral pattern formation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • digestive tract morphogenesis • prostate gland development • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation • positive regulation of cell cycle G1/S phase transition
|
| Джерела:Amigo / QuickGO
|
|
| Шаблон експресії
|
 |
|
Більше даних
|
| Ортологи |
| Види |
Людина |
Миша |
| Entrez |
|
|
| Ensembl |
|
|
| UniProt |
|
|
| RefSeq (мРНК) |
|
|
| RefSeq (білок) |
|
|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 57.46 – 57.47 Mb
|
Хр. 10: 127.17 – 127.18 Mb
|
|
PubMed search |
|
|
| Вікідані |
|
GLI1 (англ. GLI family zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 106 амінокислот, а молекулярна маса — 117 904.
Послідовність амінокислот
| 10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
| MFNSMTPPPI |
|
SSYGEPCCLR |
|
PLPSQGAPSV |
|
GTEGLSGPPF |
|
CHQANLMSGP |
| HSYGPARETN |
|
SCTEGPLFSS |
|
PRSAVKLTKK |
|
RALSISPLSD |
|
ASLDLQTVIR |
| TSPSSLVAFI |
|
NSRCTSPGGS |
|
YGHLSIGTMS |
|
PSLGFPAQMN |
|
HQKGPSPSFG |
| VQPCGPHDSA |
|
RGGMIPHPQS |
|
RGPFPTCQLK |
|
SELDMLVGKC |
|
REEPLEGDMS |
| SPNSTGIQDP |
|
LLGMLDGRED |
|
LEREEKREPE |
|
SVYETDCRWD |
|
GCSQEFDSQE |
| QLVHHINSEH |
|
IHGERKEFVC |
|
HWGGCSRELR |
|
PFKAQYMLVV |
|
HMRRHTGEKP |
| HKCTFEGCRK |
|
SYSRLENLKT |
|
HLRSHTGEKP |
|
YMCEHEGCSK |
|
AFSNASDRAK |
| HQNRTHSNEK |
|
PYVCKLPGCT |
|
KRYTDPSSLR |
|
KHVKTVHGPD |
|
AHVTKRHRGD |
| GPLPRAPSIS |
|
TVEPKREREG |
|
GPIREESRLT |
|
VPEGAMKPQP |
|
SPGAQSSCSS |
| DHSPAGSAAN |
|
TDSGVEMTGN |
|
AGGSTEDLSS |
|
LDEGPCIAGT |
|
GLSTLRRLEN |
| LRLDQLHQLR |
|
PIGTRGLKLP |
|
SLSHTGTTVS |
|
RRVGPPVSLE |
|
RRSSSSSSIS |
| SAYTVSRRSS |
|
LASPFPPGSP |
|
PENGASSLPG |
|
LMPAQHYLLR |
|
ARYASARGGG |
| TSPTAASSLD |
|
RIGGLPMPPW |
|
RSRAEYPGYN |
|
PNAGVTRRAS |
|
DPAQAADRPA |
| PARVQRFKSL |
|
GCVHTPPTVA |
|
GGGQNFDPYL |
|
PTSVYSPQPP |
|
SITENAAMDA |
| RGLQEEPEVG |
|
TSMVGSGLNP |
|
YMDFPPTDTL |
|
GYGGPEGAAA |
|
EPYGARGPGS |
| LPLGPGPPTN |
|
YGPNPCPQQA |
|
SYPDPTQETW |
|
GEFPSHSGLY |
|
PGPKALGGTY |
| SQCPRLEHYG |
|
QVQVKPEQGC |
|
PVGSDSTGLA |
|
PCLNAHPSEG |
|
PPHPQPLFSH |
| YPQPSPPQYL |
|
QSGPYTQPPP |
|
DYLPSEPRPC |
|
LDFDSPTHST |
|
GQLKAQLVCN |
| YVQSQQELLW |
|
EGGGREDAPA |
|
QEPSYQSPKF |
|
LGGSQVSPSR |
|
AKAPVNTYGP |
| GFGPNLPNHK |
|
SGSYPTPSPC |
|
HENFVVGANR |
|
ASHRAAAPPR |
|
LLPPLPTCYG |
| PLKVGGTNPS |
|
CGHPEVGRLG |
|
GGPALYPPPE |
|
GQVCNPLDSL |
|
DLDNTQLDFV |
| AILDEPQGLS |
|
PPPSHDQRGS |
|
SGHTPPPSGP |
|
PNMAVGNMSV |
|
LLRSLPGETE |
| FLNSSA |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
-
Kinzler K.W., Ruppert J.M., Bigner S.H., Vogelstein B. (1988). The GLI gene is a member of the Kruppel family of zinc finger proteins.. Nature 332: 371 — 374. PubMed DOI:10.1038/332371a0
-
Lo H.W., Zhu H., Cao X., Aldrich A., Ali-Osman F. (2009). A novel splice variant of GLI1 that promotes glioblastoma cell migration and invasion.. Cancer Res. 69: 6790 — 6798. PubMed DOI:10.1158/0008-5472.CAN-09-0886
-
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
-
Kinzler K.W., Vogelstein B. (1990). The GLI gene encodes a nuclear protein which binds specific sequences in the human genome.. Mol. Cell. Biol. 10: 634 — 642. PubMed DOI:10.1128/MCB.10.2.634
-
Koyabu Y., Nakata K., Mizugishi K., Aruga J., Mikoshiba K. (2001). Physical and functional interactions between Zic and Gli proteins.. J. Biol. Chem. 276: 6889 — 6892. PubMed DOI:10.1074/jbc.C000773200
-
Maloverjan A., Piirsoo M., Michelson P., Kogerman P., Osterlund T. (2010). Identification of a novel serine/threonine kinase ULK3 as a positive regulator of Hedgehog pathway.. Exp. Cell Res. 316: 627 — 637. PubMed DOI:10.1016/j.yexcr.2009.10.018
Див. також
|
|
|
|
|
(1) Основні домени
|
|
|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
|
|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
|
| (1.4) NF-1 |
|
|
| (1.5) RF-X |
|
|
|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
|
|
|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК
|
|
|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
|
| підродина 1 |
|
|
| підродина 2 |
|
|
| підродина 3 |
|
|
| підродина 4 |
|
|
| підродина 5 |
|
|
| підродина 6 |
|
|
| підродина 0 |
|
|
|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
|
|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
|
|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
|
| (2.6) WRKY |
|
|
|
|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
|
|
|
|
(3.1) Гомеобокс
|
|
|
| (3.2) Парний бокс |
|
|
|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
|
|
(3.4) Фактори теплового шоку |
|
|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
|
|
|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
|
|
|
|
(4.1) RHR |
|
|
|
(4.2) STAT |
|
|
| (4.3) p53 |
|
|
|
(4.4) MADS |
|
|
|
(4.6) TATA |
|
|
| (4.7) Високомобільна група |
|
|
| (4.9) Grainyhead |
|
|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
|
| (4.11) Runt |
|
|
|
|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції
|
|
|
| (0.2) HMGI(Y) |
|
|
| (0.3) Pocket домен |
|
|
|
(0.5) AP2/EREBP-подібні
|
|
|
| (0.6) Інші |
|
|
|
|