SCAPER (англ. S-phase cyclin A associated protein in the ER) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 400 амінокислот, а молекулярна маса — 158 287.
Послідовність амінокислот
| 10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
| MMASFQRSNS |
|
HDKVRRIVAE |
|
EGRTARNLIA |
|
WSVPLESKDD |
|
DGKPKCQTGG |
| KSKRTIQGTH |
|
KTTKQSTAVD |
|
CKITSSTTGD |
|
KHFDKSPTKT |
|
RHPRKIDLRA |
| RYWAFLFDNL |
|
RRAVDEIYVT |
|
CESDQSVVEC |
|
KEVLMMLDNY |
|
VRDFKALIDW |
| IQLQEKLEKT |
|
DAQSRPTSLA |
|
WEVKKMSPGR |
|
HVIPSPSTDR |
|
INVTSNARRS |
| LNFGGSTGTV |
|
PAPRLAPTGV |
|
SWADKVKAHH |
|
TGSTASSEIT |
|
PAQSCPPMTV |
| QKASRKNERK |
|
DAEGWETVQR |
|
GRPIRSRSTA |
|
VMPKVSLATE |
|
ATRSKDDSDK |
| ENVCLLPDES |
|
IQKGQFVGDG |
|
TSNTIESHPK |
|
DSLHSCDHPL |
|
AEKTQFTVST |
| LDDVKNSGSI |
|
RDNYVRTSEI |
|
SAVHIDTECV |
|
SVMLQAGTPP |
|
LQVNEEKFPA |
| EKARIENEMD |
|
PSDISNSMAE |
|
VLAKKEELAD |
|
RLEKANEEAI |
|
ASAIAEEEQL |
| TREIEAEENN |
|
DINIETDNDS |
|
DFSASMGSGS |
|
VSFCGMSMDW |
|
NDVLADYEAR |
| ESWRQNTSWG |
|
DIVEEEPARP |
|
PGHGIHMHEK |
|
LSSPSRKRTI |
|
AESKKKHEEK |
| QMKAQQLREK |
|
LREEKTLKLQ |
|
KLLEREKDVR |
|
KWKEELLDQR |
|
RRMMEEKLLH |
| AEFKREVQLQ |
|
AIVKKAQEEE |
|
AKVNEIAFIN |
|
TLEAQNKRHD |
|
VLSKLKEYEQ |
| RLNELQEERQ |
|
RRQEEKQARD |
|
EAVQERKRAL |
|
EAERQARVEE |
|
LLMKRKEQEA |
| RIEQQRQEKE |
|
KAREDAARER |
|
ARDREERLAA |
|
LTAAQQEAME |
|
ELQKKIQLKH |
| DESIRRHMEQ |
|
IEQRKEKAAE |
|
LSSGRHANTD |
|
YAPKLTPYER |
|
KKQCSLCNVL |
| ISSEVYLFSH |
|
VKGRKHQQAV |
|
RENTSIQGRE |
|
LSDEEVEHLS |
|
LKKYIIDIVV |
| ESTAPAEALK |
|
DGEERQKNKK |
|
KAKKIKARMN |
|
FRAKEYESLM |
|
ETKNSGSDSP |
| YKAKLQRLAK |
|
DLLKQVQVQD |
|
SGSWANNKVS |
|
ALDRTLGEIT |
|
RILEKENVAD |
| QIAFQAAGGL |
|
TALEHILQAV |
|
VPATNVNTVL |
|
RIPPKSLCNA |
|
INVYNLTCNN |
| CSENCSDVLF |
|
SNKITFLMDL |
|
LIHQLTVYVP |
|
DENNTILGRN |
|
TNKQVFEGLT |
| TGLLKVSAVV |
|
LGCLIANRPD |
|
GNCQPATPKI |
|
PTQEMKNKPS |
|
QGDPFNNRVQ |
| DLISYVVNMG |
|
LIDKLCACFL |
|
SVQGPVDENP |
|
KMAIFLQHAA |
|
GLLHAMCTLC |
| FAVTGRSYSI |
|
FDNNRQDPTG |
|
LTAALQATDL |
|
AGVLHMLYCV |
|
LFHGTILDPS |
| TASPKENYTQ |
|
NTIQVAIQSL |
|
RFFNSFAALH |
|
LPAFQSIVGA |
|
EGLSLAFRHM |
| ASSLLGHCSQ |
|
VSCESLLHEV |
|
IVCVGYFTVN |
|
HPDNQVIVQS |
|
GRHPTVLQKL |
| CQLPFQYFSD |
|
PRLIKVLFPS |
|
LIAACYNNHQ |
|
NKIILEQEMS |
|
CVLLATFIQD |
| LAQTPGQAEN |
|
QPYQPKGKCL |
|
GSQDYLELAN |
|
RFPQQAWEEA |
|
RQFFLKKEKK |
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
-
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 143 — 150. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.2.143
-
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
-
Tsang W.Y., Wang L., Chen Z., Sanchez I., Dynlacht B.D. (2007). SCAPER, a novel cyclin A-interacting protein that regulates cell cycle progression.. J. Cell Biol. 178: 621 — 633. PubMed DOI:10.1083/jcb.200701166
Див. також
