Мы используем файлы cookie.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.
SLITRK1
Другие языки:

SLITRK1

Подписчиков: 0, рейтинг: 0
SLITRK1
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SLITRK1, LRRC12, TTM, SLIT and NTRK like family member 1, slitrk1
Зовнішні ІД OMIM: 609678 MGI: 2679446 HomoloGene: 14174 GeneCards: SLITRK1
Пов'язані генетичні захворювання
трихотіломанія
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_052910
NM_001281503
NM_199065
RefSeq (білок)
NP_001268432
NP_443142
NP_951020
Локус (UCSC) Хр. 13: 83.88 – 83.88 Mb Хр. 14: 109.15 – 109.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLITRK1 (англ. SLIT and NTRK like family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 696 амінокислот, а молекулярна маса — 77 735.

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLLWILLLET SLCFAAGNVT GDVCKEKICS CNEIEGDLHV DCEKKGFTSL
QRFTAPTSQF YHLFLHGNSL TRLFPNEFAN FYNAVSLHME NNGLHEIVPG
AFLGLQLVKR LHINNNKIKS FRKQTFLGLD DLEYLQADFN LLRDIDPGAF
QDLNKLEVLI LNDNLISTLP ANVFQYVPIT HLDLRGNRLK TLPYEEVLEQ
IPGIAEILLE DNPWDCTCDL LSLKEWLENI PKNALIGRVV CEAPTRLQGK
DLNETTEQDL CPLKNRVDSS LPAPPAQEET FAPGPLPTPF KTNGQEDHAT
PGSAPNGGTK IPGNWQIKIR PTAAIATGSS RNKPLANSLP CPGGCSCDHI
PGSGLKMNCN NRNVSSLADL KPKLSNVQEL FLRDNKIHSI RKSHFVDYKN
LILLDLGNNN IATVENNTFK NLLDLRWLYM DSNYLDTLSR EKFAGLQNLE
YLNVEYNAIQ LILPGTFNAM PKLRILILNN NLLRSLPVDV FAGVSLSKLS
LHNNYFMYLP VAGVLDQLTS IIQIDLHGNP WECSCTIVPF KQWAERLGSE
VLMSDLKCET PVNFFRKDFM LLSNDEICPQ LYARISPTLT SHSKNSTGLA
ETGTHSNSYL DTSRVSISVL VPGLLLVFVT SAFTVVGMLV FILRNRKRSK
RRDANSSASE INSLQTVCDS SYWHNGPYNA DGAHRVYDCG SHSLSD

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, синапсах. Також секретований назовні.

Література

  • Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins.. DNA Res. 8: 179 — 187.  PubMed DOI:10.1093/dnares/8.4.179
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Aruga J., Yokota N., Mikoshiba K. (2003). Human SLITRK family genes: genomic organization and expression profiling in normal brain and brain tumor tissue.. Gene 315: 87 — 94.  PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(03)00715-7
  • Kajiwara Y., Buxbaum J.D., Grice D.E. (2009). SLITRK1 binds 14-3-3 and regulates neurite outgrowth in a phosphorylation-dependent manner.. Biol. Psychiatry 66: 918 — 925.  PubMed DOI:10.1016/j.biopsych.2009.05.033
  • Beaubien F., Raja R., Kennedy T.E., Fournier A.E., Cloutier J.F. (2016). Slitrk1 is localized to excitatory synapses and promotes their development.. Sci. Rep. 6: 27343 — 27343.  PubMed DOI:10.1038/srep27343

Див. також



Новое сообщение