SPTAN1
Подписчиков: 0, рейтинг: 0
SPTAN1 (англ. Spectrin alpha, non-erythrocytic 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 472 амінокислот, а молекулярна маса — 284 539.
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MDPSGVKVLE | TAEDIQERRQ | QVLDRYHRFK | ELSTLRRQKL | EDSYRFQFFQ | ||||
| RDAEELEKWI | QEKLQIASDE | NYKDPTNLQG | KLQKHQAFEA | EVQANSGAIV | ||||
| KLDETGNLMI | SEGHFASETI | RTRLMELHRQ | WELLLEKMRE | KGIKLLQAQK | ||||
| LVQYLRECED | VMDWINDKEA | IVTSEELGQD | LEHVEVLQKK | FEEFQTDMAA | ||||
| HEERVNEVNQ | FAAKLIQEQH | PEEELIKTKQ | DEVNAAWQRL | KGLALQRQGK | ||||
| LFGAAEVQRF | NRDVDETISW | IKEKEQLMAS | DDFGRDLASV | QALLRKHEGL | ||||
| ERDLAALEDK | VKALCAEADR | LQQSHPLSAT | QIQVKREELI | TNWEQIRTLA | ||||
| AERHARLNDS | YRLQRFLADF | RDLTSWVTEM | KALINADELA | SDVAGAEALL | ||||
| DRHQEHKGEI | DAHEDSFKSA | DESGQALLAA | GHYASDEVRE | KLTVLSEERA | ||||
| ALLELWELRR | QQYEQCMDLQ | LFYRDTEQVD | NWMSKQEAFL | LNEDLGDSLD | ||||
| SVEALLKKHE | DFEKSLSAQE | EKITALDEFA | TKLIQNNHYA | MEDVATRRDA | ||||
| LLSRRNALHE | RAMRRRAQLA | DSFHLQQFFR | DSDELKSWVN | EKMKTATDEA | ||||
| YKDPSNLQGK | VQKHQAFEAE | LSANQSRIDA | LEKAGQKLID | VNHYAKDEVA | ||||
| ARMNEVISLW | KKLLEATELK | GIKLREANQQ | QQFNRNVEDI | ELWLYEVEGH | ||||
| LASDDYGKDL | TNVQNLQKKH | ALLEADVAAH | QDRIDGITIQ | ARQFQDAGHF | ||||
| DAENIKKKQE | ALVARYEALK | EPMVARKQKL | ADSLRLQQLF | RDVEDEETWI | ||||
| REKEPIAAST | NRGKDLIGVQ | NLLKKHQALQ | AEIAGHEPRI | KAVTQKGNAM | ||||
| VEEGHFAAED | VKAKLHELNQ | KWEALKAKAS | QRRQDLEDSL | QAQQYFADAN | ||||
| EAESWMREKE | PIVGSTDYGK | DEDSAEALLK | KHEALMSDLS | AYGSSIQALR | ||||
| EQAQSCRQQV | APTDDETGKE | LVLALYDYQE | KSPREVTMKK | GDILTLLNST | ||||
| NKDWWKVEVN | DRQGFVPAAY | VKKLDPAQSA | SRENLLEEQG | SIALRQEQID | ||||
| NQTRITKEAG | SVSLRMKQVE | ELYHSLLELG | EKRKGMLEKS | CKKFMLFREA | ||||
| NELQQWINEK | EAALTSEEVG | ADLEQVEVLQ | KKFDDFQKDL | KANESRLKDI | ||||
| NKVAEDLESE | GLMAEEVQAV | QQQEVYGMMP | RDETDSKTAS | PWKSARLMVH | ||||
| TVATFNSIKE | LNERWRSLQQ | LAEERSQLLG | SAHEVQRFHR | DADETKEWIE | ||||
| EKNQALNTDN | YGHDLASVQA | LQRKHEGFER | DLAALGDKVN | SLGETAERLI | ||||
| QSHPESAEDL | QEKCTELNQA | WSSLGKRADQ | RKAKLGDSHD | LQRFLSDFRD | ||||
| LMSWINGIRG | LVSSDELAKD | VTGAEALLER | HQEHRTEIDA | RAGTFQAFEQ | ||||
| FGQQLLAHGH | YASPEIKQKL | DILDQERADL | EKAWVQRRMM | LDQCLELQLF | ||||
| HRDCEQAENW | MAAREAFLNT | EDKGDSLDSV | EALIKKHEDF | DKAINVQEEK | ||||
| IAALQAFADQ | LIAAGHYAKG | DISSRRNEVL | DRWRRLKAQM | IEKRSKLGES | ||||
| QTLQQFSRDV | DEIEAWISEK | LQTASDESYK | DPTNIQSKHQ | KHQAFEAELH | ||||
| ANADRIRGVI | DMGNSLIERG | ACAGSEDAVK | ARLAALADQW | QFLVQKSAEK | ||||
| SQKLKEANKQ | QNFNTGIKDF | DFWLSEVEAL | LASEDYGKDL | ASVNNLLKKH | ||||
| QLLEADISAH | EDRLKDLNSQ | ADSLMTSSAF | DTSQVKDKRD | TINGRFQKIK | ||||
| SMAASRRAKL | NESHRLHQFF | RDMDDEESWI | KEKKLLVGSE | DYGRDLTGVQ | ||||
| NLRKKHKRLE | AELAAHEPAI | QGVLDTGKKL | SDDNTIGKEE | IQQRLAQFVE | ||||
| HWKELKQLAA | ARGQRLEESL | EYQQFVANVE | EEEAWINEKM | TLVASEDYGD | ||||
| TLAAIQGLLK | KHEAFETDFT | VHKDRVNDVC | TNGQDLIKKN | NHHEENISSK | ||||
| MKGLNGKVSD | LEKAAAQRKA | KLDENSAFLQ | FNWKADVVES | WIGEKENSLK | ||||
| TDDYGRDLSS | VQTLLTKQET | FDAGLQAFQQ | EGIANITALK | DQLLAAKHVQ | ||||
| SKAIEARHAS | LMKRWSQLLA | NSAARKKKLL | EAQSHFRKVE | DLFLTFAKKA | ||||
| SAFNSWFENA | EEDLTDPVRC | NSLEEIKALR | EAHDAFRSSL | SSAQADFNQL | ||||
| AELDRQIKSF | RVASNPYTWF | TMEALEETWR | NLQKIIKERE | LELQKEQRRQ | ||||
| EENDKLRQEF | AQHANAFHQW | IQETRTYLLD | GSCMVEESGT | LESQLEATKR | ||||
| KHQEIRAMRS | QLKKIEDLGA | AMEEALILDN | KYTEHSTVGL | AQQWDQLDQL | ||||
| GMRMQHNLEQ | QIQARNTTGV | TEEALKEFSM | MFKHFDKDKS | GRLNHQEFKS | ||||
| CLRSLGYDLP | MVEEGEPDPE | FEAILDTVDP | NRDGHVSLQE | YMAFMISRET | ||||
| ENVKSSEEIE | SAFRALSSEG | KPYVTKEELY | QNLTREQADY | CVSHMKPYVD | ||||
| GKGRELPTAF | DYVEFTRSLF | VN |
Кодований геном білок за функцією належить до кепінгів актину. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Cianci C.D., Zhang Z., Pradhan D., Morrow J.S. (1999). Brain and muscle express a unique alternative transcript of alphaII spectrin.. Biochemistry 38: 15721 — 15730. PubMed DOI:10.1021/bi991458k
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- McMahon A.P., Moon R.T. (1987). Structure and evolution of a non-erythroid spectrin, human alpha-fodrin.. Biochem. Soc. Trans. 15: 804 — 807. PubMed DOI:10.1042/bst0150804
- Stabach P.R., Cianci C.D., Glantz S.B., Zhang Z., Morrow J.S. (1997). Site-directed mutagenesis of alpha II spectrin at codon 1175 modulates its mu-calpain susceptibility.. Biochemistry 36: 57 — 65. PubMed DOI:10.1021/bi962034i
- Lundberg S., Bjoerk J., Loefvenberg L., Backman L. (1995). Cloning, expression and characterization of two putative calcium-binding sites in human non-erythroid alpha-spectrin.. Eur. J. Biochem. 230: 658 — 665. PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.0658h.x
- Holaska J.M., Kowalski A.K., Wilson K.L. (2004). Emerin caps the pointed end of actin filaments: evidence for an actin cortical network at the nuclear inner membrane.. PLoS Biol. 2: 1354 — 1362. PubMed DOI:10.1371/journal.pbio.0020231
Див. також
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||