| STAT6
|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|
Символи
|
STAT6, D12S1644, IL-4-STAT, STAT6B, STAT6C, signal transducer and activator of transcription 6 |
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601512 MGI: 103034 HomoloGene: 2373 GeneCards: STAT6
|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|
eosinophilic esophagitis
|
| Онтологія гена |
| Молекулярна функція |
• identical protein binding • sequence-specific DNA binding • protein phosphatase binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • Нуклеоплазма • membrane raft • цитоплазма • гіалоплазма • Ядерна мембрана
|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • T-helper 1 cell lineage commitment • regulation of cell population proliferation • response to cytokine • interleukin-4-mediated signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to hydrogen peroxide • mammary gland epithelial cell proliferation • cellular response to reactive nitrogen species • positive regulation of type I interferon production • positive regulation of isotype switching to IgE isotypes • mammary gland morphogenesis • negative regulation of type 2 immune response • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 Сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of cold-induced thermogenesis • defense response • receptor signaling pathway via JAK-STAT • response to peptide hormone • growth hormone receptor signaling pathway via JAK-STAT
|
| Джерела:Amigo / QuickGO
|
|
| Шаблон експресії
|

|
|
Більше даних
|
| Ортологи |
| Види |
Людина |
Миша |
| Entrez |
|
|
| Ensembl |
|
|
| UniProt |
|
|
| RefSeq (мРНК) |
|
|
| RefSeq (білок) |
|
|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 57.1 – 57.13 Mb
|
Хр. 10: 127.48 – 127.5 Mb
|
|
PubMed search |
|
|
| Вікідані |
|
STAT6 (англ. Signal transducer and activator of transcription 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 847 амінокислот, а молекулярна маса — 94 135.
Послідовність амінокислот
| 10 |
|
20 |
|
30 |
|
40 |
|
50 |
| MSLWGLVSKM |
|
PPEKVQRLYV |
|
DFPQHLRHLL |
|
GDWLESQPWE |
|
FLVGSDAFCC |
| NLASALLSDT |
|
VQHLQASVGE |
|
QGEGSTILQH |
|
ISTLESIYQR |
|
DPLKLVATFR |
| QILQGEKKAV |
|
MEQFRHLPMP |
|
FHWKQEELKF |
|
KTGLRRLQHR |
|
VGEIHLLREA |
| LQKGAEAGQV |
|
SLHSLIETPA |
|
NGTGPSEALA |
|
MLLQETTGEL |
|
EAAKALVLKR |
| IQIWKRQQQL |
|
AGNGAPFEES |
|
LAPLQERCES |
|
LVDIYSQLQQ |
|
EVGAAGGELE |
| PKTRASLTGR |
|
LDEVLRTLVT |
|
SCFLVEKQPP |
|
QVLKTQTKFQ |
|
AGVRFLLGLR |
| FLGAPAKPPL |
|
VRADMVTEKQ |
|
ARELSVPQGP |
|
GAGAESTGEI |
|
INNTVPLENS |
| IPGNCCSALF |
|
KNLLLKKIKR |
|
CERKGTESVT |
|
EEKCAVLFSA |
|
SFTLGPGKLP |
| IQLQALSLPL |
|
VVIVHGNQDN |
|
NAKATILWDN |
|
AFSEMDRVPF |
|
VVAERVPWEK |
| MCETLNLKFM |
|
AEVGTNRGLL |
|
PEHFLFLAQK |
|
IFNDNSLSME |
|
AFQHRSVSWS |
| QFNKEILLGR |
|
GFTFWQWFDG |
|
VLDLTKRCLR |
|
SYWSDRLIIG |
|
FISKQYVTSL |
| LLNEPDGTFL |
|
LRFSDSEIGG |
|
ITIAHVIRGQ |
|
DGSPQIENIQ |
|
PFSAKDLSIR |
| SLGDRIRDLA |
|
QLKNLYPKKP |
|
KDEAFRSHYK |
|
PEQMGKDGRG |
|
YVPATIKMTV |
| ERDQPLPTPE |
|
LQMPTMVPSY |
|
DLGMAPDSSM |
|
SMQLGPDMVP |
|
QVYPPHSHSI |
| PPYQGLSPEE |
|
SVNVLSAFQE |
|
PHLQMPPSLG |
|
QMSLPFDQPH |
|
PQGLLPCQPQ |
| EHAVSSPDPL |
|
LCSDVTMVED |
|
SCLSQPVTAF |
|
PQGTWIGEDI |
|
FPPLLPPTEQ |
| DLTKLLLEGQ |
|
GESGGGSLGA |
|
QPLLQPSHYG |
|
QSGISMSHMD |
|
LRANPSW |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
-
Patel B.K., Keck C.L., O'Leary R.S., Popescu N.C., LaRochelle W.J. (1998). Localization of the human stat6 gene to chromosome 12q13.3-q14.1, a region implicated in multiple solid tumors.. Genomics 52: 192 — 200. PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5436
-
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
-
Litterst C.M., Pfitzner E. (2002). An LXXLL motif in the transactivation domain of STAT6 mediates recruitment of NCoA-1/SRC-1.. J. Biol. Chem. 277: 36052 — 36060. PubMed DOI:10.1074/jbc.M203556200
Див. також
|
|
|
|
|
(1) Основні домени
|
|
|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
|
|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
|
| (1.4) NF-1 |
|
|
| (1.5) RF-X |
|
|
|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
|
|
|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК
|
|
|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
|
| підродина 1 |
|
|
| підродина 2 |
|
|
| підродина 3 |
|
|
| підродина 4 |
|
|
| підродина 5 |
|
|
| підродина 6 |
|
|
| підродина 0 |
|
|
|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
|
|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
|
|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
|
| (2.6) WRKY |
|
|
|
|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
|
|
|
|
(3.1) Гомеобокс
|
|
|
| (3.2) Парний бокс |
|
|
|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
|
|
(3.4) Фактори теплового шоку |
|
|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
|
|
|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
|
|
|
|
(4.1) RHR |
|
|
|
(4.2) STAT |
|
|
| (4.3) p53 |
|
|
|
(4.4) MADS |
|
|
|
(4.6) TATA |
|
|
| (4.7) Високомобільна група |
|
|
| (4.9) Grainyhead |
|
|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
|
| (4.11) Runt |
|
|
|
|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції
|
|
|
| (0.2) HMGI(Y) |
|
|
| (0.3) Pocket домен |
|
|
|
(0.5) AP2/EREBP-подібні
|
|
|
| (0.6) Інші |
|
|
|
|