Мы используем файлы cookie.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.

ZNF180

Другие языки:

English

ZNF180

Подписчиков: 0, рейтинг: 0

ZNF180

Ідентифікатори

Символи

ZNF180, HHZ168, zinc finger protein 180

Зовнішні ІД

OMIM: 606740 MGI: 1923701 HomoloGene: 8306 GeneCards: ZNF180

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7733


210135

Ensembl


ENSG00000167384


ENSMUSG00000057101

UniProt


Q9UJW8


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001278508 NM_001278509 NM_001288759 NM_001288760 NM_001288761
NM_001288762 NM_001291633 NM_013256

NM_001045486 NM_001289634 NM_001289637 NM_001289640 NM_001289641
NM_172483

RefSeq (білок)

NP_001265437 NP_001265438 NP_001275688 NP_001275689 NP_001275690
NP_001275691 NP_001278562 NP_037388


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 44.47 – 44.5 Mb

Хр. 7: 23.78 – 23.81 Mb

PubMed search

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZNF180 (англ. Zinc finger protein 180) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 692 амінокислот, а молекулярна маса — 79 111.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRACAGSTRE	AGSGAQDLST	LLCLEESMEE	QDEKPPEPPK	ACAQDSFLPQ
EIIIKVEGED	TGSLTIPSQE	GVNFKIVTVD	FTREEQGTWN	PAQRTLDRDV
ILENHRDLVS	WDLATAVGKK	DSTSKQRIFD	EEPANGVKIE	RFTRDDPWLS
SCEEVDDCKD	QLEKQQEKQE	ILLQEVAFTQ	RKAVIHERVC	KSDETGEKSG
LNSSLFSSPV	IPIRNHFHKH	VSHAKKWHLN	AAVNSHQKIN	ENETLYENNE
CGKPPQSIHL	IQFTRTQTKD	KCYGFSDRIQ	SFCHGTPLHI	HEKIHGGGKT
FDFKECGQVL	NPKISHNEQQ	RIPFEESQYK	CSETSHSSSL	TQNMRNNSEE
KPFECNQCGK	SFSWSSHLVA	HQRTHTGEKP	YECSECGKSF	SRSSHLVSHQ
RTHTGEKPYR	CNQCGKSFSQ	SYVLVVHQRT	HTGEKPYECN	QCGKSFRQSY
KLIAHQRTHT	GEKPYECNQC	GKSFIQSYKL	IAHQRIHTGE	KPYECNQCGK
SFSQSYKLVA	HQRTHTGEKP	FECNQCGKSF	SWSSQLVAHQ	RTHTGEKPYE
CSECGKSFNR	SSHLVMHQRI	HTGEKPYECN	QCGKSFSQSY	VLVVHQRTHT
GEKPYECSQC	GKSFRQSSCL	TQHQRTHTGE	KPFECNQCGK	TFSLSARLIV
HQRTHTGEKP	FTCIQCGKAF	INSYKLIRHQ	ATHTEEKLYE	CN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Shannon M., Hamilton A.T., Gordon L., Branscomb E., Stubbs L. (2003). Differential expansion of zinc-finger transcription factor loci in homologous human and mouse gene clusters.. Genome Res. 13: 1097 — 1110. PubMed DOI:10.1101/gr.963903
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791. PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

Хромосома 19