Люмікан (англ. Lumican) – білок, який кодується геном LUM, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 38 429.
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MSLSAFTLFL | ALIGGTSGQY | YDYDFPLSIY | GQSSPNCAPE | CNCPESYPSA | ||||
| MYCDELKLKS | VPMVPPGIKY | LYLRNNQIDH | IDEKAFENVT | DLQWLILDHN | ||||
| LLENSKIKGR | VFSKLKQLKK | LHINHNNLTE | SVGPLPKSLE | DLQLTHNKIT | ||||
| KLGSFEGLVN | LTFIHLQHNR | LKEDAVSAAF | KGLKSLEYLD | LSFNQIARLP | ||||
| SGLPVSLLTL | YLDNNKISNI | PDEYFKRFNA | LQYLRLSHNE | LADSGIPGNS | ||||
| FNVSSLVELD | LSYNKLKNIP | TVNENLENYY | LEVNQLEKFD | IKSFCKILGP | ||||
| LSYSKIKHLR | LDGNRISETS | LPPDMYECLR | VANEVTLN |
Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Grover J., Chen X.-N., Korenberg J.R., Roughley P.J. (1995). The human lumican gene. Organization, chromosomal location, and expression in articular cartilage.. J. Biol. Chem. 270: 21942 — 21949. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.37.21942
- Chakravarti S., Stallings R.L., Sundar-Raj N., Cornuet P.K., Hassell J.R. (1995). Primary structure of human lumican (keratan sulfate proteoglycan) and localization of the gene (LUM) to chromosome 12q21.3-q22.. Genomics 27: 481 — 488. PubMed DOI:10.1006/geno.1995.1080
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Onnerfjord P., Heathfield T.F., Heinegaard D. (2004). Identification of tyrosine sulfation in extracellular leucine-rich repeat proteins using mass spectrometry.. J. Biol. Chem. 279: 26 — 33. PubMed DOI:10.1074/jbc.M308689200
- Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry.. Proteomics 4: 454 — 465. PubMed DOI:10.1002/pmic.200300556